[发明专利]一种建立药物代谢酶基因与药物代谢的关系模型的方法在审
申请号: | 201710725476.5 | 申请日: | 2017-08-22 |
公开(公告)号: | CN107273710A | 公开(公告)日: | 2017-10-20 |
发明(设计)人: | 王琦;张浩 | 申请(专利权)人: | 北京岙特杰诺生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06F19/24 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙)11371 | 代理人: | 王闯 |
地址: | 100000 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种建立药物代谢酶基因与药物代谢的关系模型的方法,所述方法通过检索获得大量涉及药物代谢酶基因和药物代谢酶的文献,通过数据分析对检索获得的大量文献进行聚类分析,确定单个多态性位点与药物代谢类型的关系以及多个多态性位点组合与药物代谢类型的关系,最终获得药物代谢酶基因与药物代谢的关系模型,所述模型具有能够客观、全面而准确地评价药物代谢酶基因的多态性与药物代谢类型之间的关联的优点。 | ||
搜索关键词: | 一种 建立 药物 代谢 基因 关系 模型 方法 | ||
【主权项】:
一种建立药物代谢酶基因与药物代谢的关系模型的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:a、检索a1、确定检索目的:检索涉及第一药物代谢酶基因的多态性的文献和涉及目标药物代谢的文献;a2、根据检索目的,制定检索策略;a3、执行检索操作;a4、排除不符合条件的检索结果,将符合条件的检索结果汇总;b、数据分析b1、对汇总的检索结果进行聚类分析,评估第一药物代谢酶基因的单个多态性位点的类型与药物代谢类型的关联;优选地,所述聚类分析至少包括META分析和/或系统性评价;b2、评估第一药物代谢酶基因的多个基因多态性位点的组合类型与药物代谢类型的关联;b3、根据b1和b2的评估结果对第一药物代谢酶基因的单个多态性位点的不同类型进行赋值;b4、根据b2的评估结果和b3的赋值结果建立第一药物代谢酶基因的总赋值和药物代谢类型的对应关系,其中,所述第一药物代谢酶基因的总赋值为所述基因的多个多态性位点的赋值的加和。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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