[发明专利]用于检测水稻ALS基因发生SNP突变的KASP标记引物及其应用在审

专利信息
申请号: 201711120320.0 申请日: 2017-11-14
公开(公告)号: CN107653337A 公开(公告)日: 2018-02-02
发明(设计)人: 韶也;赵炳然;毛毕刚;彭彦;唐丽;胡远益;李曜魁;张丹 申请(专利权)人: 湖南杂交水稻研究中心
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 长沙朕扬知识产权代理事务所(普通合伙)43213 代理人: 杨斌
地址: 410000*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开了一种用于检测水稻ALS基因中Ser627Asn和Val643Met同时发生SNP突变的KASP标记引物,针对水稻ALS基因中Ser627Asn和Val643Met同时发生的SNP突变,在以双突变ALS基因表型为标记性状时,该双突变ALS基因序列为全新未见报道的基因序列,能够先初步通过抗除草剂表型锁定所标记材料,再通过基因内部双KASP标记精准确定被标记水稻材料,可快速、高准确率、高通量鉴定水稻抗乙酰乳酸合成酶抑制剂类除草剂。KASP标记引物用于分子标记辅助选育具有除草剂抗性的杂交稻品种时,两对KASP标记的结果相互验证,以便更有效率地通过喷施除草剂除掉不育系“打摆子”自交来的种苗。
搜索关键词: 用于 检测 水稻 als 基因 发生 snp 突变 kasp 标记 引物 及其 应用
【主权项】:
一种用于检测水稻ALS基因中Ser627Asn发生SNP突变的KASP标记引物,其特征在于,所检测的目标基因型包括水稻ALS基因中第1880位G和A,该标记引物包括引物1、引物2和通用引物3;所述引物1包括第一荧光标签序列、最后一个特定碱基1和位于所述碱基1上游可实现PCR反应的若干碱基,所述最后一个特定碱基1为水稻ALS基因中第1880位A;所述引物2包括第二荧光标签序列、最后一个特定碱基2和位于所述碱基2上游可实现PCR反应的若干碱基,所述最后一个特定碱基2为水稻ALS基因中第1880位G。
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