[发明专利]一种并行分离核酸片断的拼接算法及其应用有效

专利信息
申请号: 201711168549.1 申请日: 2017-11-21
公开(公告)号: CN107944221B 公开(公告)日: 2020-12-29
发明(设计)人: 吕华;张吉华;陈功俊 申请(专利权)人: 南京溯远基因科技有限公司
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B25/00;G01N27/447
代理公司: 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 代理人: 王闯
地址: 211899 江苏省南京市浦口区江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明涉及医学诊断领域,具体而言,涉及一种并行分离核酸片断的拼接算法及其应用。该方法包括:选择通道i,对内标信号进行峰识别,记录各峰的位置;将内标信号的峰位按照从小到大的顺序排列;根据各通道信号特征,选择相应的峰位,从而确定各通道的信号提取范围;提取通道i对应的范围内的除内标以外的其余信号;计算通道i的电泳电压Vi与通道1电泳电压V1的比例ki;将所提取的所述信号根据所述比例ki进行伸缩变换,以使得通道i与通道1的所述信号的一致;重复上述步骤直至得到所有通道经过伸缩后的结果;根据通道顺序,将各通道保存的结果进行拼接,得到完整的基因片断信息。该方法可将分割后的核酸片断进行拼接,从而可以大幅度加快检测速度。
搜索关键词: 一种 并行 分离 核酸 片断 拼接 算法 及其 应用
【主权项】:
一种并行分离核酸片断的拼接算法,其特征在于,包括:步骤120:选择通道i,对内标信号进行峰识别,记录各峰的位置;步骤130:将内标信号的峰位按照从小到大的顺序排列;步骤140:根据各通道信号特征,选择相应的峰位,从而确定各通道的信号提取范围;步骤150:提取通道i对应的范围内的除内标以外的其余信号;步骤160:计算通道i的电泳电压Vi与通道1电泳电压V1的比例ki;步骤170:将步骤150提取的所述信号根据所述比例ki进行伸缩变换,以使得通道i与通道1的所述信号的一致;步骤180:重复步骤120‑170,得到所有通道经过伸缩后的结果;步骤190:根据通道顺序,将各通道保存的结果进行拼接,得到完整的基因片断信息。
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