[发明专利]分子对接方法及系统有效
| 申请号： | 201711214050.X | 申请日： | 2017-11-28 |
| 公开（公告）号： | CN107992718B | 公开（公告）日： | 2022-04-08 |
| 发明（设计）人： | 常珊;梅向东;陆旭峰 | 申请（专利权）人： | 江苏理工学院 |
| 主分类号： | G16C20/50 | 分类号： | G16C20/50;G16C20/20 |
| 代理公司： | 常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙) 32231 | 代理人： | 陈丽萍 |
| 地址： | 213001 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种分子对接方法及系统，其中，在该分子对接方法中包括：CPU处理端读入作为受体的静态分子结构及作为配体的动态分子结构，分别进行预处理得到网格数据后传送至GPU运算端；GPU运算端接收到受体和配体的网格数据，分别进行傅里叶变换得到频域数据后进行点积操作得到复合物频域数据；GPU运算端根据得到的复合物频域数据计算得到匹配因子并将其传送至CPU处理端；CPU处理端根据接收到的匹配因子得到预设数量的最佳对接位置，实现受体和配体的对接操作。其充分利用了GPU运算端的高浮点运算能力，大大减少了分子对接过程中的运行成本，加速分子对接的运行速度，提高资源的利用效率。 | ||
| 搜索关键词： | 分子 对接 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种分子对接方法，其特征在于，包括CPU处理端和GPU运算端，所述分子对接方法中包括：CPU处理端读入作为受体的静态分子结构及作为配体的动态分子结构，分别进行预处理得到网格数据后传送至GPU运算端；GPU运算端接收到受体和配体的网格数据，分别进行傅里叶变换得到频域数据后进行点积操作得到复合物频域数据；GPU运算端根据得到的复合物频域数据计算得到匹配因子并将其传送至CPU处理端；CPU处理端根据接收到的匹配因子得到预设数量的最佳对接位置，实现受体和配体的对接操作。
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