[发明专利]一种利用碳基纳米材料提升细菌群落多样性检测准确性的方法在审

专利信息
申请号: 201711287578.X 申请日: 2017-12-07
公开(公告)号: CN108060219A 公开(公告)日: 2018-05-22
发明(设计)人: 邓晔;厉舒帧;宋茂勇 申请(专利权)人: 中国科学院生态环境研究中心
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 代理人: 张拥
地址: 100085*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种利用碳基纳米材料提升细菌群落多样性检测准确性的方法,包括以下步骤:(1)采集细菌群落样本,提取细菌群落样本的16SrRNA基因,并根据细菌群落样本的16SrRNA基因设计并合成上下游引物;(2)将碳基纳米材料与PCR扩增反应体系混合均匀,并利用上下游引物扩增细菌群落样本的16SrRNA基因;(3)PCR产物分离纯化后,构建文库后进行高通量测序,对测序数据进行处理后,分析嵌合体数量并去除嵌合体序列,然后对非嵌合体序列进行比对,确定错配序列的数量。本发明的碳基纳米材料能够减少细菌群落多样性检测过程嵌合体及错配碱基的产生,从而提升细菌群落多样性检测的准确性。
搜索关键词: 一种 利用 纳米 材料 提升 细菌 群落 多样性 检测 准确性 方法
【主权项】:
1.一种利用碳基纳米材料提升细菌群落多样性检测准确性的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)采集细菌群落样本,提取细菌群落样本的16SrRNA基因,并根据细菌群落样本的16SrRNA基因设计并合成上下游引物;(2)将碳基纳米材料与PCR扩增反应体系混合均匀,并利用上下游引物扩增细菌群落样本的16SrRNA基因;(3)PCR产物分离纯化后,构建文库后进行高通量测序,对测序数据进行处理后,分析嵌合体数量并去除嵌合体序列,然后对非嵌合体序列进行比对,确定错配序列的数量。
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