[发明专利]利用来自细菌基因组和质粒的全部基因信息集用于改善的基因抗性测试在审
| 申请号： | 201780023638.9 | 申请日： | 2017-04-12 |
| 公开（公告）号： | CN109715831A | 公开（公告）日： | 2019-05-03 |
| 发明（设计）人： | 瓦伦蒂娜·加拉塔;安德烈亚斯·凯勒;霍尔格·奎斯特;苏珊娜·施默尔克 | 申请（专利权）人： | 阿瑞斯遗传股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/689 | 分类号： | C12Q1/689 |
| 代理公司： | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人： | 王达佐;洪欣 |
| 地址： | 奥地利*** | 国省代码： | 奥地利;AT |
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| 摘要： | 本发明涉及确定微生物的抗微生物药物抗性谱的方法，其中分析所述微生物的核酸序列中的至少两个核酸序列的基因变异，所述至少两个核酸序列的基因变异包含染色体中的至少一个基因变异和至少一个质粒中的至少一个基因变异；以及确定患者感染了对抗微生物药物治疗可能具有抗性的微生物的(例如诊断)方法和选择对患有可能具有抗性的微生物感染的患者的治疗的方法，其中应用所述抗微生物药物抗性谱的数据。 | ||
| 搜索关键词： | 基因变异 核酸序列 微生物 抗微生物药物 抗性谱 抗性 质粒 微生物感染 微生物药物 细菌基因组 患者感染 基因抗性 基因信息 染色体 治疗 测试 诊断 对抗 应用 分析 | ||
【主权项】：
1.确定微生物的抗微生物药物抗性谱的方法，其包括：‑获得或者提供所述微生物的多个临床分离物的核酸序列的第一数据集，其中将所述第一数据集的核酸序列的至少一部分组装；和/或获得或者提供所述微生物的多个临床分离物的核酸序列的第一数据集并将所述第一数据集的核酸序列与至少一个参照序列进行比对；‑分析所述第一数据集的核酸序列中所述核酸序列的至少两个基因变异以获得结构变体的第三数据集，所述至少两个基因变异包含染色体中的至少一个基因变异和至少一个质粒中的至少一个基因变异；‑提供所述微生物的多个临床分离物的抗微生物药物抗性和/或敏感性的第二数据集；‑将所述第三数据集与所述第二数据集关联，并对所述关联进行统计学分析；以及‑确定所述微生物的核酸序列中与抗微生物药物抗性相关的基因变异。
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