[发明专利]用于检测博德特氏菌属的方法

摘要

本公开提供用于确定表现出百日咳样症状的患者是否从抑制霍氏博德特氏菌(Bordetella holmesii)的治疗剂的治疗中获益的方法。这些方法基于通过分别测定IS481、IS1001和hIS1001靶重复元件的存在来检测生物样品中的百日咳博德特氏菌(Bordetella pertussis)、副百日咳博德特氏菌(Bordetella parapertussis)和霍氏博德特氏菌。还提供用于实施所述方法的试剂盒。

主权项

1.一种用于检测生物样品中至少一种致病性博德特氏菌属菌种(Bordetella species)的存在的方法，其包括：(a)使该生物样品与下列接触：i.扩增IS481靶核酸的第一引物对，其包括与SEQ ID NO:1或其互补序列至少85‑95％相同的核苷酸；ii.扩增IS1001靶核酸的第二引物对，其包括与SEQ ID NO:2或其互补序列至少85‑95％相同的核苷酸；和iii.扩增hIS1001靶核酸的第三引物对，其包括与SEQ ID NO:3或其互补序列至少85‑95％相同的核苷酸；以在其中发生IS481、IS1001和hIS1001靶核酸(如果其存在于生物样品中的话)的扩增而不从该生物样品中提取该靶核酸的情况下产生反应‑样品混合物；(b)使所述反应‑样品混合物经受实时PCR条件，在该条件下扩增该生物样品中存在的各靶核酸以产生荧光信号；(c)检测由在步骤(b)中产生的各扩增的靶核酸生成的荧光信号；和(d)通过评估各靶核酸的荧光信号来检测该生物样品中至少一种致病性博德特氏菌属菌种的存在，由此i.当检测到针对hIS1001靶核酸的荧光信号时，在该生物样品中检测到霍氏博德特氏菌(B.holmesii)；ii.当检测到针对IS1001靶核酸的荧光信号时，在该生物样品中检测到副百日咳博德特氏菌(B.parapertussis)；和iii.当检测到针对IS481靶核酸的荧光信号且未检测到针对hIS1001的荧光信号时，在该生物样品中检测到百日咳博德特氏菌(B.pertussis)；其中该致病性博德特氏菌属菌种是百日咳博德特氏菌、副百日咳博德特氏菌和霍氏博德特氏菌中的一种或多种；和其中该生物样品在扩增前不经提取或纯化步骤。