[发明专利]人类白细胞抗原分型方法在审
| 申请号： | 201780032905.9 | 申请日： | 2017-05-25 |
| 公开（公告）号： | CN109477143A | 公开（公告）日： | 2019-03-15 |
| 发明（设计）人： | 解超 | 申请（专利权）人： | 细胞结构公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6881 | 分类号： | C12Q1/6881;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京天昊联合知识产权代理有限公司 11112 | 代理人： | 张娜;李荣胜 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 本文描述了用于从核酸或蛋白质序列对个体进行HLA分型的方法、系统和介质。本文公开的方法代表对当前HLA分型方法的显著改进。 | ||
| 搜索关键词： | 人类白细胞抗原分型 蛋白质序列 核酸 改进 | ||
【主权项】：
1.一种确定个体的4位人类白细胞抗原(HLA)等位基因组成的方法，所述方法包括：a)将来自所述个体的至少一个核酸序列读长映射到已知HLA等位基因参考序列，以确定第一组HLA等位基因，所述第一组HLA等位基因解释所述至少一个核酸序列读长；以及b)使用已知HLA等位基因参考序列的多重序列比对(MSA)来确定一个或多个额外的HLA等位基因参考序列，所述一个或多个额外的HLA等位基因参考序列与所述第一组HLA等位基因同等良好地匹配所述至少一个核酸序列读长；其中所述个体的4位HLA等位基因组成包括所述一个或多个额外的HLA等位基因参考序列，所述一个或多个额外的HLA等位基因参考序列具有与来自所述个体的所述至少一个核酸序列读长最接近的匹配。
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