[发明专利]全转录组扩增的方法有效

专利信息
申请号: 201780034548.X 申请日: 2017-03-31
公开(公告)号: CN109312331B 公开(公告)日: 2022-08-02
发明(设计)人: C·宗 申请(专利权)人: 贝勒医学院
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12P19/34;C12Q1/6806;C40B50/06;C40B50/08
代理公司: 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 代理人: 刘晓东
地址: 美国得*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 本公开的实施方案包括用于总RNA单细胞测序的高度灵敏的定量方法。在特定情况下,方法利用多种引物与RNA的退火,对从其逆转录的单链DNA进行多核苷酸加尾,以及在引物中利用条形码以用于扩增由第二链合成产生的扩增子。
搜索关键词: 转录 扩增 方法
【主权项】:
1.一种从一个或多个细胞扩增RNA的方法,其包括以下步骤:将来自所述一个或多个细胞的RNA暴露于第一多种引物和至少一种逆转录酶以产生反应混合物;使所述反应混合物经受允许所述引物与RNA退火和第一链cDNA合成以产生延伸的DNA链的条件;消化未退火的引物;使所述反应混合物中的酶失活;消化所述反应混合物中的RNA;对所述延长的DNA链的3'末端进行加尾;在合适的条件下使用第二多种引物和至少一种DNA聚合酶产生第二链cDNA合成,以产生双链全扩增子,其中所述第一多种引物、第二多种引物或两者中的引物包含下式:XnYmZp,其中n大于2且X富含40%‑60%的G或富含40%‑60%的C,其中Y为任何核苷酸且m为5‑8个核苷酸,并且,其中当X富含G时,Z为T和G,或当X富含C时,Z为C,其中p为2‑20个核苷酸。
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