[发明专利]用于从福尔马林固定的石蜡包埋的生物样品中表征抗药性细菌的方法和组合物

摘要

本发明提供了一般可用于使用聚合酶链反应(PCR)扩增来自福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)活组织检查样品的痕量DNA序列，并且特别与此类活组织检查样品中的多药抗性幽门螺杆菌的鉴定相关的方法和组合物。

主权项

1.一种用于在样品内检测多个基因中的突变的方法，所述方法包括：a)鉴定适合于产生扩增子的PCR引物对，所述扩增子包含含有一个或多个突变的每个基因的区域，b)将包含一个或多个引物的PCR引物对分离成分开的PCR引物对库，所述一个或多个引物干扰通过另一个PCR引物对的扩增子生成，其中所述分开的PCR引物对库各自包含多个PCR引物对；c)从每个分开的PCR引物对库和由样品中分离的靶DNA生成扩增子；d)将从每个分开的PCR引物对库和靶DNA产生的所有扩增子组合成样品扩增子库，将独特的索引序列加入样品扩增子库内的扩增子，以生成加索引的样品扩增子库，任选地还将加索引的样品扩增子库与来自不同样品的一个或多个差异索引的样品扩增子库组合，并且同时测序所有加索引的样品扩增子；和e)通过参考相应的野生型基因序列，鉴定来自样品的加索引的测序的扩增子内的突变。