[发明专利]基于CRISPR的文库制备和测序的方法和系统在审
| 申请号： | 201780058889.0 | 申请日： | 2017-09-27 |
| 公开（公告）号： | CN109790576A | 公开（公告）日： | 2019-05-21 |
| 发明（设计）人： | 扎迦利·阿普特;杰西卡·里奇曼;丹尼尔·阿尔莫纳西德;罗德里戈·奥尔蒂斯;奥德丽·戈达德;莎拉·彼德;爱德华多·莫拉里斯 | 申请（专利权）人： | 优比欧迈公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;G01N33/48;G16B50/20;G06G7/58 |
| 代理公司： | 北京派特恩知识产权代理有限公司 11270 | 代理人： | 王子晔;姚开丽 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 用于经改进的微生物群系测序的方法和系统的实施方案，能包括：产生针对靶标集合的向导RNA复合物，所述靶标集合对应于与微生物有关病症关联的分类单位集合；用gRNA复合物处理生物样品以产生微生物核酸片段，所述微生物核酸片段包含与该靶标集合相关的末端区域集合；用共享衔接子序列的衔接子集合连接该末端区域集合；以及基于经连接的末端区域集合和共享与衔接子序列相关的引物序列的引物组扩增该靶标集合。 | ||
| 搜索关键词： | 集合 靶标 末端区域 衔接子 微生物核酸 测序 复合物处理 分类单位 生物样品 微生物群 序列相关 引物序列 引物组 共享 扩增 文库 制备 微生物 关联 改进 | ||
【主权项】：
1.一种用于改进微生物群系测序的方法，所述微生物群系测序用于表征与生物样品相关的用户的微生物有关病症，所述方法包括：·针对靶标集合产生含内切核酸酶和gRNA的向导RNA(gRNA)复合物，所述靶标集合对应于与所述微生物有关病症关联的分类单位群集合；·用所述gRNA复合物处理所述生物样品以产生微生物核酸片段，所述微生物核酸片段包含与所述靶标集合相关的末端区域集合；·用衔接子集合连接所述末端区域集合，所述衔接子集合共享衔接子序列并配置为便于对所述靶标集合进行下一代测序；·基于经连接的末端区域集合和共享与所述衔接子序列相关的引物序列的引物组扩增靶标集合；·基于经扩增的靶标集合为所述用户生成微生物序列数据集；和·基于所述微生物序列数据集确定用户对微生物有关病症的微生物群系相关表征，其中，所述微生物群系相关表征被配置为促进所述用户的微生物群系的改变以改善所述微生物有关病症的状态。
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