[发明专利]用于检测早期癌症中体细胞突变特征的识别方法在审
| 申请号： | 201780068355.6 | 申请日： | 2017-11-07 |
| 公开（公告）号： | CN109906276A | 公开（公告）日： | 2019-06-18 |
| 发明（设计）人： | 奥利弗克劳德·维恩 | 申请（专利权）人： | 格里尔公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;G16B20/20;G16B40/00 |
| 代理公司： | 上海翼胜专利商标事务所(普通合伙) 31218 | 代理人： | 翟羽 |
| 地址： | 美国加*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 本发明的各个方面包括识别多个体细胞突变特征的多种方法及系统，所述方法及系统用于检测、诊断、监测及/或分类已知患有或疑似患有癌症的一患者的癌症。在各种实施例中，本发明的方法使用一非负矩阵分解(NMF)方法以建构可用于识别一患者样品中的多个潜在特征的一特征矩阵，从而用于检测及分类癌症。在一些实施例中，本发明的方法可以使用主成分分析(PCA)或矢量量化(VQ)方法来建构一特征矩阵。 | ||
| 搜索关键词： | 特征矩阵 突变特征 癌症 建构 检测 主成分分析 方法使用 非负矩阵 个体细胞 患者样品 矢量量化 早期癌症 体细胞 分类 可用 分解 诊断 监测 | ||
【主权项】：
1.一种用于检测一患者中一癌症的存在的计算机实现的方法，其特征在于：所述方法包括：接收位在包含一处理器及一计算机可读介质的一计算机中的一数据集，其中所述数据集包括多个序列读取值，所述多个序列读取值是通过对来自所述患者的一生物试验样品中的多个核酸进行测序而获得的，并且其中所述计算机可读介质包括多个指令，当由所述处理器执行所述多个指令时使得所述计算机进行以下操作：识别所述生物试验样品中的一个或多个体细胞突变；产生包含所述一个或多个体细胞突变的一体细胞突变图谱；将所述体细胞突变图谱去卷积成一个或多个突变特征；及确认所述突变特征其中一个或多个的一个或多个曝露权重；以及根据所述一个或多个突变特征的所述一个或多个曝露权重来检测所述患者中所述癌症的存在。
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