[发明专利]利用差异丰度的k-聚体对非靶标生物体的扩增整合性遗传物质耗尽在审

专利信息
申请号: 201780077358.6 申请日: 2017-11-28
公开(公告)号: CN110088295A 公开(公告)日: 2019-08-02
发明(设计)人: 卡斯滕·迪特里希;黄意巍;马克·马特扎斯;安德里亚斯·埃马努埃勒·波施 申请(专利权)人: 西门子医疗有限公司
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844;C12Q1/70;C12Q1/04
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 李海霞
地址: 德国埃*** 国省代码: 德国;DE
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摘要: 发明涉及一种选择性扩增受试者样品中至少一种微生物和/或病毒的至少一种核酸序列的方法,其中应用k‑聚体(3),与受试者的基因组(1)相比,该k‑聚体(3)在该至少一种微生物和/或病毒的基因组(2)中显示出频率和/或背景的差异。
搜索关键词: 聚体 基因组 微生物 病毒 受试者样品 选择性扩增 生物体 核酸序列 遗传物质 整合性 靶标 丰度 扩增 耗尽 应用
【主权项】:
1.一种选择性扩增受试者的样品中至少一种微生物的至少一种病原体DNA序列的方法,所述至少一种微生物选自古细菌、细菌、原生生物和/或真菌,所述受试者是人类患者,所述方法包括:提供所述受试者的样品,其含有所述至少一种微生物的至少一种病原体DNA序列和所述受试者的至少一种人类DNA序列;确定至少一种k‑聚体,与所述受试者的基因组相比,所述至少一种k‑聚体在所述至少一种微生物的基因组中显示出频率和/或背景的差异;以及使用确定的所述至少一种k‑聚体作为引物,扩增所述样品中的所述病原体DNA序列,其特征在于,所述至少一种k‑聚体具有6个核酸的长度。
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