[发明专利]自适应纳米孔信号压缩

摘要

本文中所描述的技术涉及用于并行DNA分子测序的系统和方法。预处理器可以从包括100,000个或更多单元的传感器芯片接收原始数据帧，其中每个原始数据帧可以包括在所述100,000个或更多单元的形成期间或在使用所述100,000个或更多单元的DNA分子测序期间的给定时间处来自所述100,000个或更多单元的检测信号。预处理器然后可以从原始数据帧中提取用于确定单元的状态的相关信息，生成包括所提取的信息的一个或多个摘要帧，以及将摘要帧发送到处理器以用于处理、诸如碱基确定。由于被发送到处理器的摘要帧的数目小于原始数据帧的数目，并且摘要帧包括经预处理的数据，所以被传递到处理器的数据的量以及通过处理器的数据处理的量可以被减小。

主权项

1.一种操作被配置成并行地对至少100,000个DNA分子进行测序的测序系统的方法，所述方法包括在预处理电路处执行：从包括多个单元的传感器芯片接收数据帧的第一集合，其中所述多个单元中的每个单元被配置成生成检测信号以用于确定随时间的单元的状态，并且其中每个数据帧包括来自所述多个单元的检测信号并且对应于不同的时间；从所述数据帧的第一集合中的所述多个单元的检测信号提取信息以获得第一摘要信息，所述第一摘要信息用于用在确定所述多个单元的状态中；生成一个或多个摘要帧的第一群组，其包括从所述数据帧的第一集合提取的第一摘要信息，其中所述一个或多个摘要帧的第一群组中的摘要帧的数目小于所述数据帧的第一集合中的数据帧的数目；以及将所述一个或多个摘要帧的第一群组发送到处理器以供用在确定所述多个单元的状态中。