[发明专利]一种从马氏珠母贝基因组中高通量开发SNP位点和InDel的方法在审
| 申请号： | 201810023010.5 | 申请日： | 2018-01-10 |
| 公开（公告）号： | CN108103177A | 公开（公告）日： | 2018-06-01 |
| 发明（设计）人： | 王忠良 | 申请（专利权）人： | 广东海洋大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人： | 刘瑶云;陈伟斌 |
| 地址： | 524088 *** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种从马氏珠母贝基因组中高通量开发SNP位点和InDel的方法。该方法包括以下步骤：提取待测马氏珠母贝品系的基因组DNA；利用双链片段化酶片段化基因组DNA；DNA片段末端修复、磷酸化并加ploy(A)；经修复后的DNA片段连接接头并用磁珠法筛选300～400 bp片段；PCR文库富集及纯化；上机测序；测序数据过滤、与参考基因组进行比对、SNP和InDel检测。采用以上高通量测序技术开发马氏珠母贝基因组SNP和InDel，速度快、成本低、效率高，通过一次测序可以获得大量SNP和InDel，对于马氏珠母贝基因组的深入研究意义深远。 | ||
| 搜索关键词： | 马氏珠母贝 基因组 基因组DNA 高通量 测序 高通量测序技术 测序数据 末端修复 磁珠法 磷酸化 酶片段 片段化 比对 富集 开发 上机 双链 品系 文库 过滤 并用 筛选 修复 参考 检测 研究 | ||
【主权项】：
1.一种从马氏珠母贝基因组中高通量开发SNP位点和InDel的方法，其特征在于，包括如下步骤：S1. 提取待测马氏珠母贝品系的基因组DNA；S2. 片段化基因组DNA；S3. DNA片段末端修复、磷酸化并加腺嘌呤尾巴；S4. 将步骤S3的产物连接接头并筛选300～400 bp片段；S5. PCR文库富集及纯化；S6. 上机测序；S7. 测序数据分析。
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