[发明专利]一种从人母乳样本中提取微生物MetaDNA的方法在审
申请号: | 201810065243.1 | 申请日: | 2018-01-23 |
公开(公告)号: | CN108396025A | 公开(公告)日: | 2018-08-14 |
发明(设计)人: | 张哲;傅延;张慧;徐子静 | 申请(专利权)人: | 安徽微分基因科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806 |
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地址: | 238014 安徽省合肥市巢湖经济开发区龙泉路*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 本发明公开了一种从人母乳样本中提取微生物MetaDNA的方法,包括以下步骤:步骤一,提取母乳样本;步骤二,离心浓缩样本;步骤三,裂解样本;步骤四,离心柱结合;步骤五,高盐溶液洗涤;步骤六,洗涤静置;步骤七:DNA回溶。本发明通过使用QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit DNA快速提取试剂盒,不会影响样本中DNA的提取量、完整性、肠道菌群丰度和多样性指数的检测结果,保证了数据的准确性,通过使用市面上常见的QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit试剂盒,进行提取流程的优化和改进,最终提取出母乳中的微生物Meta DNA,并且通过PCR进行了鉴定,以证明该方案的可行,本发明的提取成功率极高,保证了实验数据的准确性,极大的提高了提取过程的效率,同时减少了不必要的资源浪费。 | ||
搜索关键词: | 样本 母乳 微生物 试剂盒 洗涤 多样性指数 肠道菌群 高盐溶液 检测结果 快速提取 离心浓缩 实验数据 离心柱 提取量 丰度 回溶 裂解 成功率 保证 优化 改进 | ||
【主权项】:
1.一种从人母乳样本中提取微生物MetaDNA的方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤一,提取母乳样本:将母乳样本放置在样本微生物提取试剂盒中存储,并分装40μL蛋白酶K至一个灭菌的2.0ml离心管中;步骤二,离心浓缩样本:a:室温解冻母乳样本,震荡混匀,准备另一个新的灭菌的2.0ml离心管分装1ml的母乳样本,85mg样本在微量离心机中离心10min;b:离心后,样本将分为三层,最上层为黄白色的脂肪层,中间为澄清的液体,最下层为白色的沉淀,吸取800μL样本中间层到分装好的蛋白酶K的离心管中,上下颠倒混匀;步骤三,裂解样本:a:向离心浓缩完成后的混合溶液中加入800μL Buffer AL,涡旋震荡,充分混匀15s;b:使用加热器70℃孵育10min;c:从加热器中取出样本管,震荡混匀,分装成两管,每管820μL;d:每管样本加入820μL无水乙醇,涡旋震荡15s充分混匀,放入‑20℃冰箱冷处理15min;步骤四,离心柱结合:将冷处理后的样本溶液转移700μL至纯化柱中过柱,12500rcf离心30s,离心后弃废液和收集管,转移纯化柱至新的收集管中,继续将冷处理后的样本溶液转移700μL至纯化柱中过柱,直至溶液全部过柱;步骤五,高盐溶液洗涤:a:向纯化柱中加入500μL Buffer AW1,20000rcf离心1min,弃去废液和收集管,转移纯化柱至一个新的收集管中;b:向纯化柱中加入500μL Buffer AW2,20000rcf离心1min,弃去废液和收集管,转移纯化柱至一个新的收集管中;步骤六,洗涤静置:a:对收集管进行空甩,20000rcf离心2min,将纯化柱转移至新的贴好标签的1.5ml离心管中,室温晾干3min;b:吸取32μL EB溶液到纯化柱底部,室温静置2min;步骤七:DNA回溶:将纯化柱和离心管在20000rcf下离心2min,离心后取下装有DNA溶液的离心管,标记好后于‑20℃保存。
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