[发明专利]检测水稻粒形QTLqGL35.1上细长粒等位基因的特异性PCR分子标记

摘要

本发明提供了检测水稻粒形QTL（quantitative trait loci,数量性状座位）qGL35.1上珍汕97细长粒等位基因的12个特异性PCR标记，分别为Wn35243、Wn35257、Wn35376、Wn35381、Wn35386、Wn35411、Wn35424、Wn35434、Wn35472、Wn35480、Wn35485和Wn35496，特征在于其PCR引物。利用这12个标记对水稻DNA进行鉴定，可以检测待测材料是否在目标座位上转入水稻品种珍汕97的细长粒等位基因，即是否具有减小粒宽、增加粒长、增加稻谷长宽比的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。

主权项

1.检测水稻粒形QTLqGL35.1上珍汕97细长粒等位基因的12个特异性PCR标记所包含的上游引物序列和下游引物序列，PCR标记名称为Wn35243、Wn35257、Wn35376、Wn35381、Wn35386、Wn35411、Wn35424、Wn35434、Wn35472、Wn35480、Wn35485和Wn35496的引物，具体序列如下：Wn35243的上游引物序列为5'-CCGGGATGATACATTAAACCAA-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:1所示的核苷酸序列；Wn35243的下游引物序列为5'-CAGAAATGGCCTAAATCCAC-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:2所示的核苷酸序列；Wn35257的上游引物序列为5'-CACCCATATATACTGGCAAT-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:3所示的核苷酸序列；Wn35257的下游引物序列为5'-CCCTTCCGAAATAACCCAA-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:4所示的核苷酸序列；Wn35376的上游引物序列为5'-CCACATAAAGCCCAAACCAA-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:5所示的核苷酸序列；Wn35376的下游引物序列为5'-TTTACATAATTAATACGGGATTGC-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:6所示的核苷酸序列；Wn35381的上游引物序列为5'-CCAGGCTGTAGGAATCCCAA-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:7的所示核苷酸序列；Wn35381的下游引物序列为5'-ACGACCGAGTTTAGTTCATAGCTTT-3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列；Wn35386的上游引物序列为5'-CATGCAATGTGCCATTCC-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:9的所示核苷酸序列；Wn35386的下游引物序列为5'-GTGTCAGCCTTAATCGTTC-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:10所示的核苷酸序列；Wn35411的上游引物序列为5'-CACTATGCTTCTATAGCTGT-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:11的所示核苷酸序列；Wn35411的下游引物序列为5'-ATTTACAAAGTTTAAGAAACCCAT-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:12所示的核苷酸序列；Wn35424的上游引物序列为5'-AGGTAAAACTTTTATATTATGCAA-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:13的所示核苷酸序列；Wn35424的下游引物序列为5'-TGTAACCCTACATCCC-3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:14 所示的核苷酸序列。Wn35434的上游引物序列为5'-TTCTACTAGGATACGTCCCAT-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:15所示的核苷酸序列；Wn35434的下游引物序列为5'-CTGGAGTTGAAGCTGCACAT-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:16所示的核苷酸序列；Wn35472的上游引物序列为5'-TATTTAAAGCCGCCCACGACA-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:17所示的核苷酸序列；Wn35472的下游引物序列为5'-TTCTTGAAATGCGGATGCTCCA-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:18所示的核苷酸序列；Wn35480的上游引物序列为5'-TCCGATGCAAACATTCACT-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:19所示的核苷酸序列；Wn35480的下游引物序列为5'-CATCGCGTCCTCGTCTTCC-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:20所示的核苷酸序列；Wn35485的上游引物序列为5'-CCATTAGGCGGTCTCCAAT-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:21的所示核苷酸序列；Wn35485的下游引物序列为5'-CCACTAGCGAGCTACTTAGGAA-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:22所示的核苷酸序列；Wn35496的上游引物序列为5'-CTCAGATCACTGGAGGTCAA-3'，所述核苷酸序列为SEQ IDNO:23的所示核苷酸序列；Wn35496的下游引物序列为5'-AAGTTGTGAAATTTATGGGTCA-3'，所述核苷酸序列为SEQID NO:24所示的核苷酸序列。