[发明专利]一种用于检测眼内液中4种革兰氏阴性细菌的LAMP引物组合及应用在审

专利信息
申请号: 201810111909.2 申请日: 2018-02-05
公开(公告)号: CN110129316A 公开(公告)日: 2019-08-16
发明(设计)人: 陶勇 申请(专利权)人: 北京智德医学检验所有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/10;C12Q1/04
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 101300 北京市顺义区仁和*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种用于检测眼内液中4种革兰氏阴性细菌的LAMP引物组合及应用。本发明首先提供了一种引物组合,由序列1至序列24所示的24种DNA分子组成。所述引物组合可应用于检测待测菌是否为大肠杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯氏菌或鲍曼不动杆菌,可应用于检测待测样本中是否含有大肠杆菌和/或铜绿假单胞菌和/或肺炎克雷伯氏菌和/或鲍曼不动杆菌。本发明提供的引物组合检测眼内液中4种革兰氏阴性细菌,具有高特异性和高灵敏度,可以实现简便、快速、准确检测。本发明具有重大的推广价值。
搜索关键词: 革兰氏阴性细菌 引物组合 眼内液 检测 肺炎克雷伯氏菌 鲍曼不动杆菌 铜绿假单胞菌 大肠杆菌 应用 待测样本 高灵敏度 准确检测
【主权项】:
1.引物组合,为如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)或(a5):(a1)由引物组Ⅰ、引物组Ⅱ、引物组Ⅲ和引物组Ⅳ组成;(a2)所述引物组Ⅰ;(a3)由“所述引物组Ⅱ、所述引物组Ⅲ和所述引物组Ⅳ中的任意一个、任意两个或三个”和所述引物组Ⅰ组成;(a4)由所述引物组Ⅰ、所述引物组Ⅱ、所述引物组Ⅲ和所述引物组Ⅳ中的任意两个或任意三个组成;(a5)所述引物组Ⅰ、所述引物组Ⅱ、所述引物组Ⅲ或所述引物组Ⅳ;所述引物组Ⅰ由引物Ⅰ‑F3、引物Ⅰ‑B3、引物Ⅰ‑FIP、引物Ⅰ‑BIP、引物Ⅰ‑LF和引物Ⅰ‑LB组成;所述引物Ⅰ‑F3为如下(b1)或(b2);(b1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;(b2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅰ‑B3为如下(b3)或(b4);(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;(b4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅰ‑FIP为如下(b5)或(b6);(b5)序列表的序列3所示的单链DNA分子;(b6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅰ‑BIP为如下(b7)或(b8);(b7)序列表的序列4所示的单链DNA分子;(b8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅰ‑LF为如下(b9)或(b10);(b9)序列表的序列5所示的单链DNA分子;(b10)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅰ‑LB为如下(b11)或(b12);(b11)序列表的序列6所示的单链DNA分子;(b12)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子;所述引物组Ⅱ由引物Ⅱ‑F3、引物Ⅱ‑B3、引物Ⅱ‑FIP、引物Ⅱ‑BIP、引物Ⅱ‑LF和引物Ⅱ‑LB组成;所述引物Ⅱ‑F3为如下(c1)或(c2);(c1)序列表的序列7所示的单链DNA分子;(c2)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅱ‑B3为如下(c3)或(c4);(c3)序列表的序列8所示的单链DNA分子;(c4)将序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列8具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅱ‑FIP为如下(c5)或(c6);(c5)序列表的序列9所示的单链DNA分子;(c6)将序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列9具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅱ‑BIP为如下(c7)或(c8);(c7)序列表的序列10所示的单链DNA分子;(c8)将序列10经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列10具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅱ‑LF为如下(c9)或(c 10);(c9)序列表的序列11所示的单链DNA分子;(c10)将序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列11具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅱ‑LB为如下(c11)或(c12);(c11)序列表的序列12所示的单链DNA分子;(c12)将序列12经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列12具有相同功能的DNA分子;所述引物组Ⅲ由引物Ⅲ‑F3、引物Ⅲ‑B3、引物Ⅲ‑FIP、引物Ⅲ‑BIP、引物Ⅲ‑LF和引物Ⅲ‑LB组成;所述引物Ⅲ‑F3为如下(d1)或(d2);(d1)序列表的序列13所示的单链DNA分子;(d2)将序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列13具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅲ‑B3为如下(d3)或(d4);(d3)序列表的序列14所示的单链DNA分子;(d4)将序列14经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列14具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅲ‑FIP为如下(d5)或(d6);(d5)序列表的序列15所示的单链DNA分子;(d6)将序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列15具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅲ‑BIP为如下(d7)或(d8);(d7)序列表的序列16所示的单链DNA分子;(d8)将序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列16具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅲ‑LF为如下(d9)或(d10);(d9)序列表的序列17所示的单链DNA分子;(d10)将序列17经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列17具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅲ‑LB为如下(d11)或(d12);(d11)序列表的序列18所示的单链DNA分子;(d12)将序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列18具有相同功能的DNA分子;所述引物组Ⅳ由引物Ⅳ‑F3、引物Ⅳ‑B3、引物Ⅳ‑FIP、引物Ⅳ‑BIP、引物Ⅳ‑LF和引物Ⅳ‑LB组成;所述引物Ⅳ‑F3为如下(e1)或(e2);(e1)序列表的序列19所示的单链DNA分子;(e2)将序列19经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列19具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅳ‑B3为如下(e3)或(e4);(e3)序列表的序列20所示的单链DNA分子;(e4)将序列20经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列20具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅳ‑FIP为如下(e5)或(e6);(e5)序列表的序列21所示的单链DNA分子;(e6)将序列21经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列21具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅳ‑BIP为如下(e7)或(e8);(e7)序列表的序列22所示的单链DNA分子;(e8)将序列22经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列22具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅳ‑LF为如下(e9)或(e10);(e9)序列表的序列23所示的单链DNA分子;(e10)将序列23经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列23具有相同功能的DNA分子;所述引物Ⅳ‑LB为如下(e11)或(e12);(e11)序列表的序列24所示的单链DNA分子;(e12)将序列24经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列24具有相同功能的DNA分子。
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