[发明专利]F型三系杂交小麦雄性不育基因相关分子标记开发及应用在审
| 申请号： | 201810161480.8 | 申请日： | 2018-02-27 |
| 公开（公告）号： | CN110195100A | 公开（公告）日： | 2019-09-03 |
| 发明（设计）人： | 吴坤;杨雅生;冯树英 | 申请（专利权）人： | 创世纪种业有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6858;C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京北翔知识产权代理有限公司 11285 | 代理人： | 屈静 |
| 地址： | 518048 广东省*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种F型三系杂交小麦雄性不育基因相关SNP位点的特异PCR标记开发方法，包括：(1)将小麦通过多代姊妹交，将获得的自交系分成自交结实率高的保持系和自交结实率中等的保持系，以及自交结实率低于5％的稳定不育系，三者除育性差异，其他生物学特征完全一致；(2)对上述三个样品进行建库测序；(3)检索三个样品线粒体及细胞核基因组间存在的SNP变异；(4)针对上述不育系与不同自交结实率的保持系株系间鉴定获得的线粒体及细胞核基因组SNP位点，检测、设计和开发限制性内切酶扩增多态性序列(CAPS)标记或竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记。本发明还公开了相关SNP位点分子标记及其检测方法。 | ||
| 搜索关键词： | 自交结实率 细胞核基因组 小麦雄性不育 分子标记 三系杂交 线粒体 等位基因特异性 限制性内切酶 特异PCR标记 扩增多态性 设计和开发 生物学特征 稳定不育 基因 不育系 自交系 姊妹交 检测 测序 多代 建库 育性 株系 检索 开发 小麦 应用 | ||
【主权项】：
1.一种F型三系杂交小麦雄性不育基因相关SNP位点的特异PCR标记开发方法，所述方法包括：(1)将小麦通过多代姊妹交，将获得的自交系分成自交结实率高的保持系和自交结实率中等的保持系，以及自交结实率低于5％的稳定不育系，三者除育性差异，其他生物学特征完全一致；(2)对上述三个样品进行建库测序：提取上述三个样品的基因组DNA，建库后进行测序；(3)基因组序列比较分析：比对小麦参考基因组数据库中线粒体及细胞核参考基因组序列，检索三个样品线粒体及细胞核基因组间存在的SNP变异；(4)F型雄性不育基因相关SNP位点特异PCR标记开发：针对上述不育系与不同自交结实率的保持系株系间鉴定获得的线粒体及细胞核基因组SNP位点，检测、设计和开发限制性内切酶扩增多态性序列(CAPS)标记或竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记。
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