[发明专利]一种利用碳基纳米材料提升真菌群落检测准确性的方法有效
| 申请号： | 201810242172.8 | 申请日： | 2018-03-22 |
| 公开（公告）号： | CN108517369B | 公开（公告）日： | 2022-10-14 |
| 发明（设计）人： | 邓晔;刘洋荧;厉舒祯 | 申请（专利权）人： | 中国科学院生态环境研究中心;中国科学院大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 | 代理人： | 张拥 |
| 地址： | 100085*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种利用碳基纳米材料提升真菌群落检测准确性的方法，包括以下步骤：(1)采集真菌群落样本，提取真菌群落样本的ITS rRNA基因，并根据真菌群落样本的ITS rRNA基因设计并合成上下游引物；(2)将碳基纳米材料与PCR扩增反应体系混合均匀，并利用上下游引物扩增真菌群落样本的ITS rRNA基因；(3)PCR产物分离纯化后，构建文库后进行高通量测序，对测序数据进行处理后，分析嵌合体所占的比例并去除嵌合体序列，然后对非嵌合体序列进行比对，确定错配序列所占的比例。本发明有效地解决了PCR扩增真菌群落样本中产生嵌合体和错配序列比例较多的问题，使得对环境中真菌群落结构检测更精确。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 利用 纳米 材料 提升 真菌 群落 检测 准确性 方法 | ||
【主权项】：
1.一种利用碳基纳米材料提升真菌群落检测准确性的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)采集真菌群落样本，提取真菌群落样本的ITS rRNA基因，并根据真菌群落样本的ITS rRNA基因设计并合成上下游引物；(2)将碳基纳米材料与PCR扩增反应体系混合均匀，并利用上下游引物扩增真菌群落样本的ITS rRNA基因；(3)PCR产物分离纯化后，构建文库后进行高通量测序，对测序数据进行处理后，分析嵌合体所占的比例并去除嵌合体序列，然后对非嵌合体序列进行比对，确定错配序列所占的比例。
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