[发明专利]绵羊资源群体的遗传多样性评价方法在审
申请号: | 201810366963.1 | 申请日: | 2018-04-23 |
公开(公告)号: | CN108611425A | 公开(公告)日: | 2018-10-02 |
发明(设计)人: | 周明亮;杨平贵;庞倩;陈明华;蒋世海 | 申请(专利权)人: | 四川省草原科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 | 代理人: | 律涛 |
地址: | 611743 四川省*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | 本发明涉及遗传多样性评价方法领域,尤其是绵羊资源群体的遗传多样性评价方法。包括以下步骤:a.采集绵羊的血液样品;b.提取血液样品的基因组DNA;c.在微卫星标记数据库中筛选30对微卫星标记引物,分布于绵羊26对常染色体和X性染色体,并通过NCBI数据库验证引物序列,微卫星标记采用5‑ROX、5'6‑FAM(FITC)、5‑TAMRA和5‑HEX进行荧光标记;d.PCR扩增及微卫星标记的等位基因分型;e.统计分析及资源群体的遗传多样性评价。本发明全面而系统地分析与评价绵羊资源群体的遗传多样性,为绵羊资源群体的开发与利用提供分子水平的理论依据,提高了评价的全面性,并节约了成本。 | ||
搜索关键词: | 资源群体 绵羊 遗传多样性评价 微卫星标记 血液样品 性染色体 微卫星标记引物 等位基因分型 遗传多样性 基因组DNA 分子水平 统计分析 验证引物 荧光标记 全面性 数据库 采集 筛选 节约 分析 开发 | ||
【主权项】:
1.一种绵羊资源群体的遗传多样性评价方法,其特征在于:包括以下步骤:a.采集绵羊的血液样品;b.提取血液样品的基因组DNA;c.在微卫星标记数据库中筛选30对微卫星标记引物,分布于绵羊26对常染色体和X性染色体,并通过NCBI数据库验证引物序列,微卫星标记采用5‑ROX、5'6‑FAM(FITC)、5‑TAMRA和5‑HEX进行荧光标记;d.PCR扩增及微卫星标记的等位基因分型;e.统计分析及资源群体的遗传多样性评价,采用软件分析微卫星标记的杂合度和多态信息含量,按照衡量基因变异程度高低的多态信息含量指标,即PIC>0.50的标记为高度多态信息位点,PIC<0.25的标记为低度多态信息位点,0.25<P<0.50的标记为中度多态信息位点,绵羊群体30个微卫星标记的遗传多态信息含量为0.3338~0.8660,其中7个标记为中度多态信息位点,23个标记为高度多态信息位点,群体的平均多态信息含量为0.6257,来表明绵羊资源群体具有丰富的遗传多态性。
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