[发明专利]一种基于核磁共振CPMG衰减曲线鉴别玉米单倍体籽粒的方法有效
申请号: | 201810377928.X | 申请日: | 2018-04-25 |
公开(公告)号: | CN108445035B | 公开(公告)日: | 2021-02-02 |
发明(设计)人: | 陈绍江;李金龙;李伟;焦炎炎;张俊稳;陈琛;陈明;刘晨旭;田小龙;钟裕;祁晓龙;王鼎昌 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | G01N24/08 | 分类号: | G01N24/08 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;何叶喧 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于核磁共振CPMG衰减曲线鉴别玉米单倍体籽粒的方法。本发明提供的方法包括如下步骤:(1)采集训练集各个玉米籽粒的核磁信号,获得每个籽粒质量归一化后的CPMG衰减曲线;(2)对0‑600ms区段进行数据处理,然后进行主成分分析,然后构建单倍体鉴别模型;(3)取待测玉米籽粒,采集核磁信号,获得质量归一化后的CPMG衰减曲线;(4)对0‑600ms区段进行数据处理,然后进行主成分分析,然后将结果代入单倍体鉴别模型,由模型输出结果。本发明提供的方法可以用于自动化鉴别,对于推动玉米单倍体育种技术工程化具有重要作用。本发明提供的鉴别玉米单倍体的方法,简单可行、快速高效,并具有广适性,具有重大的应用推广价值。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 核磁共振 cpmg 衰减 曲线 鉴别 玉米 单倍体 籽粒 方法 | ||
【主权项】:
1.一种鉴别玉米单倍体的方法,包括如下步骤:(1)采集训练集各个玉米籽粒的核磁信号,获得每个籽粒的CPMG衰减曲线,然后用每个时间点对应的振幅除以籽粒重量以归一化数据,获得每个籽粒质量归一化后的CPMG衰减曲线;训练集由若干玉米籽粒组成,其中一部分为真实单倍体,另一部分为真实二倍体;(2)对步骤(1)获得的质量归一化后的CPMG衰减曲线的0‑600ms区段进行数据处理,然后进行主成分分析,然后构建单倍体鉴别模型;(3)取待测玉米籽粒,采集核磁信号,获得CPMG衰减曲线,然后用每个时间点对应的振幅除以籽粒重量以归一化数据,获得质量归一化后的CPMG衰减曲线;(4)对步骤(3)获得的质量归一化后的CPMG衰减曲线的0‑600ms区段进行数据处理,然后进行主成分分析,然后将结果代入步骤(2)构建的单倍体鉴别模型,由模型输出该待测玉米籽粒为预测单倍体或者预测二倍体的结果。
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