[发明专利]一种用于检测可可球二孢的特异性引物及快速检测方法有效
申请号: | 201810386044.0 | 申请日: | 2018-04-26 |
公开(公告)号: | CN108531639B | 公开(公告)日: | 2019-07-19 |
发明(设计)人: | 周游;黄俊生;杨腊英;汪军;郭立佳;刘磊;梁昌聪 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 陈欢 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | 本发明公开了一种快速检测引起多种植物病害的病原菌可可球二孢(Lasiodiplodia theobromae)的特异性引物,以及用于设计特异性引物的变异区间。根据GenBank中包括Lasiodiplodia theobromae在内的葡萄座腔菌科真菌和其它种类真菌的翻译延长因子基因(Transcription elongation factor,TEF)序列,发现了可用于设计L.theobromae特异性引物的变异区间,并基于该区间序列设计了特异性强的引物对ZYLTF1/ZYLTR1,该引物对仅可以从L.theobromae中特异扩增出一条216bp的条带,而不能从其它物种中扩增出任何条带。本发明还提供了所述引物对用于Lasiodiplodia theobromae的快速检测方法,具有特异性好、灵敏度高且经济快速等优点,此方法可快速、准确的检测出L.theobromae是否存在,能在植物病害早期防控中起到关键作用。 | ||
搜索关键词: | 特异性引物 快速检测 引物 植物病害 真菌 条带 病原菌 翻译延长因子 葡萄座腔菌 关键作用 区间序列 特异扩增 特异性强 灵敏度 检测 可用 扩增 物种 基因 发现 | ||
【主权项】:
1.一种用于检测可可球二孢的特异性引物对,其特征在于,包括上游引物ZYLTF1和下游引物ZYLTR1,所述ZYLTF1和ZYLTR1的核苷酸序列分别为:ZYLTF1:5'‑acgcatgtcgttttttaa‑3',ZYLTR1:5'‑tacatgagtggtcagagcat‑3',所述可可球二孢的拉丁名为Lasiodiplodia theobromae;所述引物通过以下方式得到:利用一段翻译延长因子序列的变异区间序列设计上游引物ZYLTF1,所述变异区间序列为:acgcatgtcgttttttaacccctctcga,并根据翻译延长因子其它碱基序列设计下游引物ZYLTR1。
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