[发明专利]基于转录组序列开发的葛根SSR标记引物对及其应用有效
申请号: | 201810420944.2 | 申请日: | 2018-05-04 |
公开(公告)号: | CN108424975B | 公开(公告)日: | 2023-04-18 |
发明(设计)人: | 肖亮;严华兵;尚小红;谢向誉;曹升;陆柳英;曾文丹 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所;广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6811;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆为信知识产权代理事务所(普通合伙) 50216 | 代理人: | 蓝文苑;刘旭章 |
地址: | 530007 广西壮族自治区南宁市广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于转录组序列开发的葛根SSR标记引物对,共28对。所述SSR标记引物对是基于转录组序列开发得到的,克服了传统方式开发SSR标记步骤繁琐、工作量大、成本高的问题。最终进行SSR引物筛选与葛根种质资源遗传多样性分析,验证了SSR引物的有效性。本发明获得的SSR标记引物对是稳定存在的新标记,能够实现对葛根种质资源鉴定,亲缘关系鉴定及遗传多样性分析等奠定基础,具有很大的科学价值与应用价值。 | ||
搜索关键词: | 基于 转录 序列 开发 葛根 ssr 标记 引物 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种基于转录组序列开发的葛根SSR标记引物对,其特征在于:所述引物对共28对,分别为:第一对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:1所示,反向引物序列如SEQ ID NO:2所示;第二对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示;第三对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:5所示,反向引物序列如SEQ ID NO:6所示;第四对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:7所示,反向引物序列如SEQ ID NO:8所示;第五对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:9所示,反向引物序列如SEQ ID NO:10所示;第六对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:11所示,反向引物序列如SEQ ID NO:12所示;第七对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:13所示,反向引物序列如SEQ ID NO:14所示;第八对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:15所示,反向引物序列如SEQ ID NO:16所示;第九对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:17所示,反向引物序列如SEQ ID NO:18所示;第十对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:19所示,反向引物序列如SEQ ID NO:20所示;第十一对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:21所示,反向引物序列如SEQ ID NO:22所示;第十二对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:23所示,反向引物序列如SEQ ID NO:24所示;第十三对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:25所示,反向引物序列如SEQ ID NO:26所示;第十四对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:27所示,反向引物序列如SEQ ID NO:28所示;第十五对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:29所示,反向引物序列如SEQ ID NO:30所示;第十六对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:31所示,反向引物序列如SEQ ID NO:32所示;第十七对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:33所示,反向引物序列如SEQ ID NO:34所示;第十八对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:35所示,反向引物序列如SEQ ID NO:36所示;第十九对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:37所示,反向引物序列如SEQ ID NO:38所示;第二十对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:39所示,反向引物序列如SEQ ID NO:40所示;第二十一对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:41所示,反向引物序列如SEQ ID NO:42所示;第二十二对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:43所示,反向引物序列如SEQ ID NO:44所示;第二十三对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:45所示,反向引物序列如SEQ ID NO:46所示;第二十四对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:47所示,反向引物序列如SEQ ID NO:48所示;第二十五对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:49所示,反向引物序列如SEQ ID NO:50所示;第二十六对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:51所示,反向引物序列如SEQ ID NO:52所示;第二十七对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:53所示,反向引物序列如SEQ ID NO:54所示;第二十八对引物,其引物序列为:其正向引物序列如SEQ ID NO:55所示,反向引物序列如SEQ ID NO:56所示。
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