[发明专利]一种基于多个转录组数据集整合与药物靶标信息的重定位药物发现方法有效
申请号: | 201810455680.4 | 申请日: | 2018-05-14 |
公开(公告)号: | CN108694991B | 公开(公告)日: | 2021-01-01 |
发明(设计)人: | 李胜;孟详喻 | 申请(专利权)人: | 武汉大学中南医院 |
主分类号: | G16H20/13 | 分类号: | G16H20/13;G16B5/00;G16B25/00 |
代理公司: | 武汉大楚知识产权代理事务所(普通合伙) 42257 | 代理人: | 徐杨松 |
地址: | 430071 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于多个转录组数据集整合与药物靶标信息的重定位药物发现方法,包括以下步骤:步骤1:针对任一疾病,从开放组学数据库中获取含有表型信息的多个转录组数据集;步骤2:通过统计分析方法计算各转录组数据集中各基因与表型的关联度统计量,并将关联度统计量进行定量合并得到合并值;步骤3:构建系统生物学网络;步骤4:通过节点排序算法计算各基因的重要性评分;步骤5:获取待测药物的靶基因列表;步骤6:通过统计检验分析待测药物靶基因的重要性;预测待测药物是否为重定位药物。本发明原理清晰、高效、成本低、适用广,可用于各类疾病尤其是恶性肿瘤重定位药物的筛选与研发。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 转录 数据 整合 药物 靶标 信息 定位 发现 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于多个转录组数据集整合与药物靶标信息的重定位药物发现方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤1:针对任一疾病,从开放组学数据库中获取含有表型信息的多个转录组数据集;步骤2:通过统计分析方法计算各转录组数据集中各基因与表型的关联度统计量,在各转录组数据集中筛选与表型稳定且显著相关的基因;对筛选出的与表性稳定且显著相关的每个基因,分别定量合并其在各转录组数据集中的基因与表型的关联度统计量,得到筛选出的每个基因的关联度统计量的合并值;步骤3:根据步骤2中筛选的与表型稳定且显著相关的基因来构建系统生物学网络;步骤4:根据步骤2中得到的各基因的关联度统计量合并值和步骤3中构建的系统生物学网络,通过节点排序算法计算各基因的重要性评分;步骤5:根据药物靶标数据库中的信息,获取待测药物在所述系统生物学网络中的靶基因列表;步骤6:根据步骤4中得到的各基因的重要性评分和步骤5中得到的待测药物的靶基因列表,通过统计检验分析待测药物靶基因的重要性;当待测药物的靶基因列表中各元素重要性评分的和在重抽样分布中的百分位数大于95%时,所述待测药物为具有潜在治疗作用的重定位药物。
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