[发明专利]TRIM63基因片段作为母猪肢蹄骨密度SNP分子标记

摘要

本发明属于动物分子标记筛选技术领域，具体涉及TRIM63基因片段作为母猪肢蹄骨密度SNP分子标记。本发明通过基因芯片技术对TRIM63基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第2301位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，导致SEQ ID NO：1所示序列的多态性，且当SEQ ID NO：1上的第2301位核苷酸为G时，判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关标记的方法及其关联分析的应用。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了新的SNP分子标记。

主权项

1.一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记，其核苷酸序列如下所述:GATGTTGATTTTCTCGTCTTCGTGCTCCTTGCACATGGGGTGGCTGCCCTTCTGCAGGGGCCGACTGCAGAGGAGAAGAGTCATGAGTCACGAGGTGAGGATCTCAAGTTCCCGTCTGCCCCCCGCGCCAGCCCCAGGAGGCCACCACAGACCTGTGACTCCAGTTCTCAGGGCTTGCCTGTCCCCATCCTTTTCTTTTCATCCTCTGAGGACCCAAGACCATGAGAGCCAATGACACCAAGGCTAGGATTCAAACTCCAGTGATGGAGTTGAACTTGGGCCCTGATAGCACAGGATGTGGGAAGGGCTGTAGGATCCCAAAGTCAATTTGAGACATTTTCAAGAAGAGGAAACTGGGTTCCAGAAAGGTGAATTGACTTGCCCAAGGTCACCCAGCAAGTCAGGGCAAGGGAGGCTAGAGTTCATTTGCTCTAATTATAGTCTCCATAGCTCTTGGTTACAGCAGGCCGGGCGCTGAGCAAAGTAATTTATACTCATGGCCTCACTGAATTCTATATTTAATCCACTAGACTGTAATCTCCATCAAAGCAGGGAAACTTGCCTGTCCCTGAATCTGCAGTGTACAGTGCCTGGCGCAGAGAAGGTGGTCATTAAATACAGGCAGAAAAATAAATGGGGAAGCATGCCATGAGGGTGCCCTGAGGCTCCGAGAAGGAGGTGGTATGTGTGCCCCAAGTCACACAGCTAGAACATGGGCCATCAGGGCGTCCAACAGCCCAGCACAAGCCTTGACTTCTAGTCCAGAAATTTTTTCCAGGGTCCAGAATCACTTCTTTGCCTTTTTTCCCAAATACACACGTTTTTTGGTGTGTGTCTGCTGCATATGGAAGTTCCCAGGCCAGGGATCAAACTTGAGCCATAGCAGTAACCTGAGCCACAGCAGTGACAATGCCGAGTCCTTAAATGCTAGGGCAGGGAACTCCCCAAATACACACTCTTAGAATGACTTTCTCCCTCTGTCTCTCTCTTTGCTTCAGGCTTCTGGCATGTTCTTCTGTGCTTCTCTCAGGGTCACTTCCTACCTGAGATTCAGTTTTTGGAGTCTAGGTCTTACCGCTCCAGCTATACATTATACTCTCATTTAGAGCCAATAGCATGTCTACACCATCTCTGAGTTCCCAATCTCATAAAGGGTGAATCGTCCCCATCTGTGTCAGTGCCTCACCTCCAAACAGCCTTGCATGACTGATCTCACCCTGATCACAGACCTCAAGGTCTTAAATAAGCCCCTTTCCAGACTTGTCTTTTTGCATCTTTCAGCCCACCCCACCCCCACCCCATGCCGGCAGGGCTGTGCCTTTGCCACCTGTCTCTACCCCCGGGAAGGGATCTCGAGGAGGGCAGTAGGTACAGAGGTGAGGCAAGATCCTGGGGGTCTGGTGCCTCTGTCCTCCACCATCCCAGATGCCATCCTCCCAATCCCAGGTGCCAGCATCTGGGATCAAGTCCAGATTGATCTGCCACTTATTTACTGGGAACTTGGACAAGTGATTTTACCTCTCTGAGCCTTGCTTTTATCCCAGAGCTAGTGGGATCCTGGCAGGAGTTGTCTGTAATGATTGCATAGTGCCTGGCACAGAGCAGATCCTCTGCAACTATCATCATCCTTCAACTGTGTAGAAAGACCTCGAAGGGTTCAAACACTAGGTTCTTCCTAGGTCAACACTGGGTGGGCTAATATTTTGGTACAATATTGGTTTTATTATGATTATTATTATCACGATCGACAATATAATTGAATTTTTGCAGTGTTGAACTCTAGCAACCTGACAGGCAGTAGAAGTGACAAATGTCCACTATGGAGTCAATCAGACAGGCTTCTTCTCGGCTTCGCCACTGGCTAGCTGAGTGGCCTCGGCCAAACGTCTGCCTGCAGAAAGGCACTTGGTGATGGTTTGGGACCACAAGGGGCATGAGGTTAGAGTCTGGAGGTCCTGATTGTAAAGCTATCTCCCTGGTAGCTCTGTCTCTCCCCCTGGATCTGAGGCCCAACACTGCACAGCCTCCACCACTCACAAATTCTGCCTGAGAATGAGCTGCTGTTTCACAAGCAAGGAGACTTGGAACCGGATGGATGGGGCCGAGCAATTCTGCTTCTCGGCTGGGAAAGCTTGGGTAATTGACTTCACCTCTTTGAGCCTCAGCTTGCTCATCCGTAAAGTAGGGATGATGGTCCACAGGACTGCTCTGAAGCAGCAGCGAGAAGCAGCCCCAGTGTCTGGCGCTGTAGTTATCACCTCGGGGAAACTGGCTCTGTTCTGTGTGCTTTCTTGCTTATCRGGGCCACTGAGCTGGCCCCAGTGCCTCTGTCTCCCTCTCGCATCTCATCCTTCCCCTGGTTTCTGTCTCAGGAGGGCAGCTTAATGTCTGGGTCCCCTCCCATTCACCGAGTGACACCGAGAGCCAGGGTTCAGGGATAAGATGAGCTGCTGTTCCTGCCTGAGCAAGAGGGCTGGCTCCGGGCTGGATGAAGGGGAACAGAGCCTCGGGGAGCCAGGCTCAGAGGACAGGCTGGGGAGGAAGGACGGCCTCCCAGCCGCTGGAAAACCGACCTGGAGCACTCCTGCTTGTAGATGTCAATGATGTTCTCCACCAGCAGATTCCTCTGCAGGCCGTACACTCCGTGACGGTCCATGATCACCTCATGGCGGCAGGAGGGACAGCGGAAACGGCCTCCGGACATGGACACCGAGCCACTCCGGCTGGTCCAGTAGGGATTTGCAGCCTGCTGGTGACAAGGGCAGGGGTGAGGCCTGGGCTCCCTCCTCAGTCCCTTCCCCTTTCTGATCTCCCACCAGCCTTCTCCTGCTTACCGCCAAGAATTCTCATCAAGTCACAGGACTTAAAGCTCCCCGTCCTGGGAGGATATGTGAAAAAGAATGTATGTATATGTATATATGTAGTATGACTGGGTCACTTTGCTGTACAGCAGAAACTGGCACAACATTATAAATTAACTATACTTTAATTTAAAAAAAGTGAGGTGGTTCCGGTTGTGGTGCAGCTGTAATGAACCCGACTAGTATTGATTAGTATCCATGAGGACAGGGTTCGATCCCTGGCCTCACTCAGTGGATTAAGGAGCTTGCATTGCCATGAGCTGTGGTGTAGGTCGCAGATGAGGCTTGGATCCCGTGTTGCTGTGGCTGTAGTGTAGGCCAGAAGCTGCAGCTCCAATTCAGCCCCTAGCCTGGGAACTTCCATATGCCATGGGAGTGGCCCTAAAAAGCAAAGAAAAAAAAAAGGTAAATCTCCCCATCCTGAGATGAGAGAACAGTCACTTACACAGGGAGCATCTGAGGAGTGACTAAGCAATCAACAGGTTTGGAGGTCAACAGACCTAGGTTCAAGTCCCAGTAATTCTCTCAATGACTTTGAGCGAGCAACCTTCTCTCTCTAAGCCTCAGTTTGCCCATTCATTAAATGGGCCTATAATTAGAGCCAGCTCATAGGGCTGCTACTTTATTATTTATCTATTTCTTTATTTTAGCCATGGCCACTGCCTGTGGAAGTTCCTGGGCCAGAGATCAAACCCACACCATAGCAGTGACAACGCTGAATCCTTAACCACCTGGCCACCAGGGAACTCCCTAGGGCTGCAGCTTTAAAAACAAAGTAGTGAGAGGACATGTTGTGAAGTGCTTCTGGGGGAATCAGGAGCACTTTCTTAGGGAGAGGAAGCCTCTCCTGCCCCATAGTATAGGAAACAGCTTCAAAAAGGAAGATGCCTCTACTGCCCAGGGCCTCTCGGCCACCGGGCCACCCCTCTCCTAAAGCTCTGGGCCCCCTGCCACCTCCCAGCTGGCTCCAGCCCCTGGGGTCTGGTTTCTCTCTCCTCTCTGCTTGCCTCTCCCACTTATCGCTTGAGGCATTTGACTCCTGATTGGAGAGTCAACGGCTGCTCAGGGCAGGGGTGGGGTAGCTGCAGGCAGGGTCGGGAGGGGACATGTGCGTCATGGAGAAGGAATGGGGCAGCCAGAGCTGCCTCCCTAGCCCCCTCAGCCCCTTCCAGAAGCCTCCGGAGCAGCCATTCACTTCAGCAGGGAAACAACCCCAGGCTGGAAGGGGCCCGGGCTAAGCAAGAAGTGCTCTTTGCATTTCCATCACGGGTAAACTGAGTAGCCACTTGGGACCCCCGGACTAGGCCATGCCCAGCACTGACCTGGAAGATGTCGTTGGCACACTTTCGGCAGAGGTTGTGCTGACACGGCAAGATGACCACCGGCTTGGTAAACATCTCCAGGCAGATGGGGCAGATCAGCTGCTTCTCCAGGTTCTCCATGGGGTTCCCATCCTGGATCAGGCTTGACTTATAATCCATATTGTTGGGAGACGTGGGGACCCGCCTGGCTGCCTCCTTCACCTGCTCTAAGCAAACCTGGGGTCTTGCCTTTGTCACAAAATACCCACCCGGAGCCTCTTTGCCCTCTTCTCCTGGCGCCTGAATTCTGTCTTGGTCTGAGGCCCCTCTGATATTTATAGCTGAACCCCGGTCACATGAGCCCCAGGAGGGGACCAGCTGAGCATTCCGGTGCCAAGTGGCTGGCGAGGCTTGAGTTTCCTCCAAGCCTGAAAGACTG，上述序列的第2301位碱基处的R是A或G，导致产生多态性。