[发明专利]基于iTRAQ蛋白组学识别D-乳酸发酵过程中显著差异表达蛋白的方法在审
申请号: | 201810525268.5 | 申请日: | 2018-05-28 |
公开(公告)号: | CN108627585A | 公开(公告)日: | 2018-10-09 |
发明(设计)人: | 闻建平;梁少雄;刘欢欢 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 曹玉平 |
地址: | 300350 天津市津南区海*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本发明涉及基于iTRAQ蛋白组学识别D‑乳酸发酵过程中显著差异表达蛋白的方法;在最优发酵工艺条件下利用L.delbrueckii进行D‑乳酸生产;提取和定量L.delbrueckii在最优发酵工艺条件下对数期胞内总蛋白;对提取和定量的胞内总蛋白进行酶解和同位素标签标记;对酶解和标记的肽段进行LC‑MS/MS检测;对检测的质谱数据进行数据库检索,进行蛋白的定性和定量分析;对定性和定量蛋白根据丰度进行差异表达蛋白分析,识别显著差异表达的蛋白。通过系统生物学,首次分析L.delbrueckii在不同发酵工艺条件下,高发酵D‑乳酸过程的胞内蛋白组轮廓,达到指导后续菌种提升和进一步发酵条件优化。 | ||
搜索关键词: | 发酵工艺条件 显著差异 蛋白 表达蛋白 蛋白组学 总蛋白 酶解 定性 差异表达蛋白 乳酸发酵过程 数据库检索 同位素标签 系统生物学 定量分析 胞内蛋白 发酵过程 发酵条件 乳酸生产 质谱数据 对数期 检测 丰度 菌种 乳酸 肽段 发酵 分析 优化 | ||
【主权项】:
1.一种基于iTRAQ蛋白组学识别D‑乳酸高效发酵过程中显著差异表达蛋白的方法;具体步骤如下:1)、在最优发酵工艺条件下利用L.delbrueckii进行D‑乳酸生产;2)、提取和定量L.delbrueckii在最优发酵工艺条件下对数期胞内总蛋白;3)、对提取和定量的胞内总蛋白进行酶解和同位素标签标记;4)对酶解和标记的肽段进行LC‑MS/MS检测;5)、对检测的质谱数据进行数据库检索,进行蛋白的定性和定量分析;6)、对定性和定量蛋白根据丰度进行差异表达蛋白分析,识别显著差异表达的蛋白。
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