[发明专利]扬子鳄微卫星多态位点、鉴定方法及特异引物序列有效
| 申请号： | 201810578028.1 | 申请日： | 2018-06-05 |
| 公开（公告）号： | CN108588240B | 公开（公告）日： | 2019-09-13 |
| 发明（设计）人： | 方盛国;万秋红;马美英;夏金全 | 申请（专利权）人： | 浙江大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人： | 郑海峰 |
| 地址： | 310058 浙江*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种扬子鳄微卫星多态位点、鉴定方法及特异引物序列，及在此基础上筛选出的13对特异引物序列，其序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.26所示。鉴定扬子鳄微卫星多态位点的方法利用扬子鳄基因组筛选出微卫星位点及高质量引物；将扬子鳄基因组测序read数据比对到扬子鳄参考基因组鉴定INDEL，根据INDEL鉴定结果和微卫星筛选结果，筛选出具有多态性的微卫星位点。本发明所提供的13对微卫星引物，均为多态性位点，具有较强的分辨能力。利用这套微卫星引物，可经济、快速、正确地用于扬子鳄的亲子鉴定，有助于对扬子鳄种群进行家族谱系重建和信息完善，从而制定科学的管理方案指导扬子鳄的后期保护工作。 | ||
| 搜索关键词： | 特异引物序列 微卫星多态 位点 筛选 微卫星位点 微卫星引物 多态性位点 基因组测序 基因组鉴定 分辨能力 家族谱系 鉴定结果 亲子鉴定 数据比对 多态性 基因组 微卫星 引物 种群 参考 重建 制定 管理 | ||
【主权项】：
1.一种扬子鳄微卫星多态位点的扩增引物对组合物，其特征在于包括下述13对引物对，引物对的引物序列如下：引物对一：上游引物如SEQIDNO.1所示；下游引物如SEQIDNO.2所示；引物对二：上游引物如SEQIDNO.3所示；下游引物如SEQIDNO.4所示；引物对三：上游引物如SEQIDNO.5所示；下游引物如SEQIDNO.6所示；引物对四：上游引物如SEQIDNO.7所示；下游引物如SEQIDNO.8所示；引物对五：上游引物如SEQIDNO.9所示；下游引物如SEQIDNO.10所示；引物对六：上游引物如SEQIDNO.11所示；下游引物如SEQIDNO.12所示；引物对七：上游引物如SEQIDNO.13所示；下游引物如SEQIDNO.14所示；引物对八：上游引物如SEQIDNO.15所示；下游引物如SEQIDNO.16所示；引物对九：上游引物如SEQIDNO.17所示；下游引物如SEQIDNO.18所示；引物对十：上游引物如SEQIDNO.19所示；下游引物如SEQIDNO.20所示；引物对十一：上游引物如SEQIDNO.21所示；下游引物如SEQIDNO.22所示；引物对十二：上游引物如SEQIDNO.23所示；下游引物如SEQIDNO.24所示；引物对十三：上游引物如SEQIDNO.25所示；下游引物如SEQIDNO.26所示。
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