[发明专利]荧光原位杂交图像的细胞核分割方法及系统

摘要

本发明公开了一种荧光原位杂交图像的细胞核分割方法及系统，所述方法通过预处理、二值化、孔洞填充、形态学操作、二次分水岭等处理过程，实现FISH图像中细胞核的识别、分割。所述系统包括FISH图像接收模块、图像预处理模块、细胞核检测模块和报告生成模块。本发明在对乳腺癌、胃癌及其他癌细胞的FISH图像进行分割得到细胞核区域的时候，能够通过多次预处理减少图像荧光散射效果，可有效改善直接分水岭容易产生过分割的问题，从而提升FISH图像识别细胞的分割质量。

主权项

1.一种荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述方法包括如下步骤：1)将FISH图像中红、绿、蓝三通道图像的每一个像素点的像素值自减adt_value，实现图像的整体位移；采集三通道图像中的红色通道和绿色通道中大于otsu阈值像素点的位置，将蓝色通道中相应位置的像素点的像素值做加权处理，弥补细胞核通道中由于红绿点造成的孔洞；将蓝色通道图像中所有像素点的像素值自减h与原蓝色通道图像做灰度重建，得到重建图像img_restruct；2)对重建图像img_restruct进行二值化处理得到二值图像bw；3)二值图像bw中呈现出两种孔洞，即核内孔洞和核间孔洞，根据孔洞的几何特性做填充处理，得到孔洞图像img_hole；4)对孔洞图像img_hole进行形态学操作以平滑图像，得到形态学图像img_morph；5)对形态学图像img_morph做距离变换处理，将图像上的所有像素点的像素值自减adt_value2与自身做灰度重建再与自身做差得到前景标记临时图像fgm_tmp，去除标记面积过小的区域得到前景标记图像fgm；然后，对前景标记图像fgm做第一次分水岭得到背景标记图像bgm；对去除不属于fgm和bgm的极小值区域的梯度图像做第二次分水岭，得到细胞核分割图像及细胞核的面积、圆形度。