[发明专利]基于RT-WES的转录组测序方法在审
申请号: | 201810606040.9 | 申请日: | 2018-06-13 |
公开(公告)号: | CN108823297A | 公开(公告)日: | 2018-11-16 |
发明(设计)人: | 王冠;王晨;魏金旺;张敖;戴春;许强 | 申请(专利权)人: | 领星生物科技(上海)有限公司;上海领安生物科技有限公司;启东领星医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人: | 陆红杰 |
地址: | 201203 上海市浦东新区中国(上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于RT‑WES的转录组测序方法,步骤包括:1)提取样本总RNA;2)以总RNA为模板合成cDNA;3)构建cDNA片段化文库;4)对所述片段化文库进行全外显子捕获,富集功能基因的转录组片段;5)对所述转录组片段测序并分析测序数据。本发明采用反转录‑全外显子组测序技术,通过cDNA合成过程,先将RNA转化成DNA,再通过全外显子捕获来富集外显子信息,获得rRNA和基因组DNA干扰少、功能基因表达富集高、背景低的转录组测序数据,如此降低了对RNA的质量和起始量的要求,免去了去除rRNA干扰的步骤,为突变基因转录本表达变化分析提供了更为精准高效的途径。 | ||
搜索关键词: | 转录组 富集 外显子捕获 测序数据 功能基因 外显子 测序 文库 总RNA为模板 基因组DNA 表达变化 测序技术 片段测序 突变基因 反转录 片段化 起始量 转录本 总RNA 构建 去除 样本 分析 合成 转化 | ||
【主权项】:
1.基于RT‑WES的转录组测序方法,其特征在于,包括以下步骤:1)提取样本总RNA;2)以所述总RNA为模板,合成cDNA;3)构建cDNA片段化文库;4)对所述片段化文库进行全外显子捕获,富集功能基因的转录组片段;5)对所述转录组片段进行测序并分析测序数据。
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