[发明专利]通用隔断超快扩增镁、钠切割型功能核酸可视化检测方法在审
申请号: | 201810637034.X | 申请日: | 2018-06-20 |
公开(公告)号: | CN108949918A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 许文涛;罗云波;黄昆仑;杜再慧;田晶晶 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;黄爽 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供一种通用隔断超快扩增的镁、钠切割型功能核酸可视化检测方法。本发明通过巧妙地设计引物、模板及探针,使得在镁、钠离子存在下可对模板进行超快扩增,并使扩增产物在适宜环境中形成G四链体。进一步利用G四链体的类过氧化物酶活性进行显色,解决了传统PCR产物难于可视化检测的难题,实现了对镁、钠离子的快速、可视化检测。不仅如此,本发明提供的方法对镁、钠离子具有高特异、高灵敏的特点,检测结果更加客观、准确。 | ||
搜索关键词: | 可视化检测 钠离子 扩增 功能核酸 切割型 四链体 隔断 过氧化物酶活性 检测结果 扩增产物 设计引物 传统PCR 通用 探针 显色 灵敏 | ||
【主权项】:
1.一种快速检测镁、钠离子的系统,其特征在于,包括:(1)切割体系,(2)sPCR扩增体系,(3)HCR体系,(4)包含ABTS显色液的检测体系;所述检测体系用于对待测样品依次经由所述切割体系、sPCR扩增体系和HCR体系进行反应后所得产物进行显色检测;其中,所述切割体系包括底物链I和酶链I以及底物链II和酶链II:底物链I:5′‑CTCTATCTATrA‑GGAAGTACCGCCGC‑3′酶链I:5′‑GCGGCGGTACCAGGTCAAAGGTGGGTGAGGGGACGCCAAGAGTCCCCGCGGTTAGATAGAG‑3′其中,rA表示核糖核酸;‑表示钠离子切割位点;底物链II:5′‑GTCACGAGTCACTATrA‑GGAAGATGGCGAAA‑3′酶链II:5′‑TTTCGCCATCTTCTCCGAGCCGGTCGAAATAGTGACTCGTGAC‑3′其中,rA表示核糖核酸;‑表示镁离子切割位点;所述sPCR扩增体系包括:正向隔断引物I、反向引物I、正向隔断引物II、反向引物II、模板:正向隔断引物I:5′‑AGACGAAGCACTGGTTGAAACTCC‑隔断物‑GGAGTTTCAACCAGTGCTTCGTCTTCATCGCACCGTCAAAGGAACC‑3′反向引物I:5′‑GGAAGTACCGCCGCGGAGGGA‑3′正向隔断引物II:5′‑AGTCTAGGATTCGGCGTCCCTTAA‑隔断物‑TTAAGGGACGCCGAATCCTAGACTTCATCGCACCGTCAAAGGAACC‑3′反向引物II:5′‑GGAAGATGGCGAAATTCGGGGC‑3′模板:5′‑TCATCGCACCGTCAAAGGAACCTCAGTATCAGTGCTATACGTCGATCAGTAGCCCCGAATTTCGCCATCTTCCTCCCTCCGCGGCGGTACTTCC‑3′;所述HCR体系包括4条探针:探针1:5′‑AGGGCGGGTGGGTGGAGTTTCAACCAGTGCTTCGTCTCCCCAGACGAAGCACTGGTTGATGGGT‑3′探针2:5′‑TGGGTAGACGAAGCACTGGTTGAAACTCCTCAACCAGTGCTTCGTCTGGGGTGGGTAGGGCGGG‑3′探针3:5′‑AGGGCGGGTGGGTTAAGGGACGCCGAATCCTAGACTCAAAGTAGTCTAGGATTCGGCGTCGGGT‑3′探针4:5′‑GGGTAGTCTAGGATTCGGCGTCCCTTAAGACGCCGAATCCTAGACTACTTTGAGGGCGGGTGGG‑3′。
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