[发明专利]鲜肉源沙门氏菌ERIC-PCR溯源方法在审
申请号: | 201810810306.1 | 申请日: | 2018-07-20 |
公开(公告)号: | CN109112223A | 公开(公告)日: | 2019-01-01 |
发明(设计)人: | 韦平;刘书宏;梁竞臻;王培坤;石梦雅;黄腾;磨美兰;韦天超 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/10;C12R1/42 |
代理公司: | 广西南宁公平知识产权代理有限公司 45104 | 代理人: | 杨立华 |
地址: | 530022 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明公开了一种鲜肉源沙门氏菌ERIC‑PCR溯源方法,提取鲜肉源同一血清型沙门氏菌分离株基因组DNA作为模板,运用ERIC‑PCR技术扩增其序列,PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后获得鲜肉源沙门氏菌分离株基因组DNA的ERIC‑PCR指纹图谱;应用Gel‑Pro Analyzer 4.0对ERIC‑PCR指纹图谱进行凝胶定量分析,矩阵化后用NTSYS‑pc进行UPGMA聚类分析;然后,通过对沙门氏菌分离株的基因分型结果与其采样时间、地点的比较,追溯其污染来源。该法通过ERIC‑PCR实现快速准确地溯源,弥补了传统分型方法的不足,具有简便、分辨率高、重现性好、费用低廉的特点,可在基层推广。 | ||
搜索关键词: | 沙门氏菌 分离株 溯源 基因组DNA 指纹图谱 琼脂糖凝胶电泳 血清型沙门氏菌 定量分析 基因分型 污染来源 矩阵化 重现性 分辨率 采样 分型 扩增 凝胶 追溯 应用 基层 | ||
【主权项】:
1.一种鲜肉源沙门氏菌ERIC‑PCR溯源方法,其特征在于:提取鲜肉源同一血清型沙门氏菌分离株基因组DNA作为模板,运用ERIC‑PCR技术扩增其序列,PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后获得鲜肉源沙门氏菌分离株基因组DNA的ERIC‑PCR指纹图谱;应用Gel‑Pro Analyzer 4.0对ERIC‑PCR指纹图谱进行凝胶定量分析,矩阵化后用NTSYS‑pc进行UPGMA聚类分析;然后,通过对沙门氏菌分离株的基因分型结果与其采样时间、地点的比较,追溯其污染来源。
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