[发明专利]一种全转录组范围单碱基分辨率检测RNA内部N7-甲基鸟苷修饰的方法及试剂盒有效
| 申请号： | 201810885063.8 | 申请日： | 2018-08-06 |
| 公开（公告）号： | CN108841934B | 公开（公告）日： | 2021-09-14 |
| 发明（设计）人： | 滕花景;陈云;梁加龙;孙中生 | 申请（专利权）人： | 中国科学院动物研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人： | 刘奇 |
| 地址： | 100000 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： |
本发明提供了一种全转录组范围单碱基分辨率检测RNA内部m |
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| 搜索关键词： | 一种 转录 范围 碱基 分辨率 检测 rna 内部 n7 甲基 修饰 方法 试剂盒 | ||
【主权项】：
1.一种全转录组范围单碱基分辨率检测RNA内部m7G修饰的方法，包括以下步骤：1)提取样本细胞总RNA获得样本细胞全转录组RNA；2)将所述样本细胞全转录组RNA断裂为100～300bp的片段化RNA；3)用硼氢化钠溶液还原所述片段化RNA获得还原RNA；4)所述还原后的30s内，用苯胺盐酸盐溶液断裂所述还原RNA，在所述断裂后的RNA两端连接测序接头；反转录连有测序接头的RNA片段后，用测序引物进行PCR扩增构建测序文库；5)对所述测序文库进行测序获得测序数据；6)分析所述测序数据得到RNA断点次数和测序深度的比值，所述比值大于0.5，且断点位置是G碱基位点的被确定是m7G位点。
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