[发明专利]一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌的酶切方法有效
| 申请号： | 201810929537.4 | 申请日： | 2018-08-15 |
| 公开（公告）号： | CN108949901B | 公开（公告）日： | 2022-07-15 |
| 发明（设计）人： | 刘倩倩;陈彬彬;张治洲;何宏魁;曹润洁;李安军 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨工业大学（威海） |
| 主分类号： | C12Q1/44 | 分类号： | C12Q1/44;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙) 11562 | 代理人： | 张换君 |
| 地址： | 264209 山东省威海市文*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明属于生物技术领域，涉及一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法，该方法包含以下步骤：(1)将窖泥中含量最高的30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对，找出各属的代表性序列2‑4个；(2)各属代表性序列的酶切分析，从中找出来甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种；(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种特征性酶切方式。(4)经过确认的特征性酶切方式再进行实验验证。(5)最终确认至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。本发明可达到从窖泥厌氧菌群中快速识别甲烷囊菌属细菌的目的，比起常规测序鉴定节省大量时间。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 快速 鉴定 窖泥中 甲烷 方法 | ||
【主权项】：
1.一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法，该方法包含以下步骤：(1)优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对，找出各属代表性序列；(2)各属代表性序列的酶切分析，找出甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种；(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式，确认至少一种特征性酶切方式；(4)经过确认的特征性酶切方式通过进行实验验证进一步确认；(5)最终确认的至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。
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