[发明专利]一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法在审
申请号: | 201811024725.9 | 申请日: | 2018-09-04 |
公开(公告)号: | CN109097439A | 公开(公告)日: | 2018-12-28 |
发明(设计)人: | 赵小东;康亚妮;邵志峰;胡丛霞 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/6804 | 分类号: | C12Q1/6804 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 崔佳佳;马莉华 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明提供了一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法。具体地,本发明的方法包括步骤:(a)提供DNA片段;(b)在所述DNA片段两端添加接头;(c)向所述末端带有接头的DNA中加入辅助核酸片段,形成第一混合物;(d)将所述第一混合物进行热变性,使双链DNA成为单链DNA,形成第二混合物;(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的核酸片段进行捕获;(f)用特异性引物对被捕获的核酸片段进行扩增,从而获得含有甲基化的核酸片段的扩增产物。本发明的方法适用于极少量来源样品的甲基化核酸测序分析,而且成本较低,具有很高的普遍适用性。 | ||
搜索关键词: | 甲基化 核酸片段 全基因组DNA 第二混合物 第一混合物 种检测 甲基化核酸 普遍适用性 特异性抗体 特异性引物 测序分析 辅助核酸 扩增产物 单链DNA 双链DNA 热变性 扩增 捕获 | ||
【主权项】:
1.一种检测全基因组DNA甲基化的方法,其特征在于,包括步骤:(a)提供DNA片段,所述DNA片段包括源自细胞基因组DNA;(b)在所述DNA片段两端添加接头,得到末端带有接头的DNA;(c)向所述末端带有接头的DNA片段中加入辅助核酸片段,形成第一混合物;(d)将所述第一混合物进行热变性,使第一混合物中的双链DNA成为单链DNA,从而形成第二混合物;(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的DNA片段进行捕获;(f)用特异性引物对被捕获的DNA片段进行扩增,从而获得对应于甲基化的DNA片段的扩增产物;(g)对所述扩增产物进行检测,从而获得全基因组DNA甲基化的检测结果。
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