[发明专利]微卫星不稳定性状态的二代测序引物探针组及其检测方法在审
申请号: | 201811041738.7 | 申请日: | 2018-09-07 |
公开(公告)号: | CN109082470A | 公开(公告)日: | 2018-12-25 |
发明(设计)人: | 赵新泰;王明;潘文健 | 申请(专利权)人: | 上海赛安生物医药科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869 |
代理公司: | 上海海颂知识产权代理事务所(普通合伙) 31258 | 代理人: | 任益 |
地址: | 200436 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种微卫星不稳定性状态的二代测序检测方法,包括以下步骤:分别对肿瘤患者的癌变组织样本和正常组织对照品进行DNA片段化处理,末端补齐加A尾,进行接头连接;设计用于目的区域捕获的引物和探针以及用于扩增的引物,探针是分别针对五个微卫星位点的单向DNA延伸探针,采用探针和引物进行目的区域捕获后扩增得到文库;测序得到癌变组织样本和正常组织对照品的五个微卫星位点的重复序列长度分布数据,对比两者数据,判断微卫星位点的稳定性。本发明还涉及一种微卫星不稳定性状态的二代测序引物探针组。本发明的微卫星不稳定性状态的二代测序检测方法可以减少测序深度对结果判定的影响,简单易行,准确度高,灵敏度高,成本低。 | ||
搜索关键词: | 定性状态 微卫星 探针 微卫星位点 引物 癌变组织 测序检测 测序引物 区域捕获 正常组织 对照品 探针组 测序 扩增 样本 长度分布数据 准确度 接头连接 结果判定 重复序列 灵敏度 补齐 文库 肿瘤 检测 | ||
【主权项】:
1.一种微卫星不稳定性状态的二代测序引物探针组,其特征在于:包括探针MSI‑1、探针MSI‑2、探针MSI‑3、探针MSI‑4、探针MSI‑5、引物FP‑1和引物UP‑2;所述探针MSI‑1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述探针MSI‑2的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,所述探针MSI‑3的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述探针MSI‑4的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示,所述探针MSI‑5的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,所述引物FP‑1的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示,所述引物UP‑2的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示。
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