[发明专利]一种肠道病毒组的高通量检测方法及应用有效
申请号: | 201811130676.7 | 申请日: | 2018-09-27 |
公开(公告)号: | CN109215736B | 公开(公告)日: | 2021-10-08 |
发明(设计)人: | 宁康;韩毛振;杨朋硕;钟朝芳 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B30/00 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 熊娴;冯子玲 |
地址: | 436000 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明公开了一种肠道病毒组的高通量检测方法,其中,所述方法以Kraken自带的病毒库(衍生于Refseq的病毒库)为基础,建立现有样本数据库的肠道病毒组分注释平台和肠道病毒组分分析平台,肠道组分分析平台分析肠道组分注释平台获得的数据,并以构建预测模型和肠道病毒数据集,再将高通量测序待测样本的肠道病毒组与预测模型比对,比对结果用于判断宿主的血压与设定阈值对比,对比后概率值最高的一组数据为待测样本的对比结果。本发明以人类肠道微生物群落里的病毒组作为研究对象,基于微生物组和生物信息学思路,提供一种利用肠道病毒组样本预测高血压的方法,具有周期短、无创取样、通用性高、附加值高等特点。 | ||
搜索关键词: | 一种 肠道 病毒组 通量 检测 方法 应用 | ||
【主权项】:
1.一种肠道病毒组的高通量检测方法,其特征在于:所述方法以Kraken自带的病毒库为基础,建立现有样本数据库的肠道病毒组分注释平台和肠道病毒组分分析平台,肠道组分分析平台分析肠道组分注释平台获得的数据,并以构建预测模型和肠道病毒数据集,再将高通量测序待测样本的肠道病毒组与预测模型比对,比对结果用于判断宿主的血压与设定阈值对比,对比后概率值最高的一组数据为待测样本的对比结果。
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