[发明专利]使用目标基因表达的概率建模评估细胞信号传导途径活性在审
申请号: | 201811176740.5 | 申请日: | 2012-07-19 |
公开(公告)号: | CN109852671A | 公开(公告)日: | 2019-06-07 |
发明(设计)人: | W·F·J·维哈伊格;A·范德斯托佩;H·J·范奥詹;K·C·杜拉;M·阿维斯德恩达;R·霍夫曼恩 | 申请(专利权)人: | 皇家飞利浦有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6809 | 分类号: | C12Q1/6809;C12Q1/6886;G16B40/00;G16B5/00 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 杜艳玲;陈岚 |
地址: | 荷兰艾*** | 国省代码: | 荷兰;NL |
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摘要: | 本申请主要涉及特定方法,其至少基于医疗受试者的组织的提取样品中测量的一种或多种细胞信号传导途径的一个或多个目标基因的一个或多个表达水平来推断所述医疗个体的组织中一种或多种细胞信号传导途径的活性;装置,其包含配置以进行此类方法的数字压缩机;和非临时性存储介质,其存储由数字处理设备可执行以进行此类方法的指令。 | ||
搜索关键词: | 细胞信号传导途径 数字处理设备 表达水平 存储介质 多个目标 非临时性 概率建模 目标基因 可执行 压缩机 推断 医疗 测量 存储 指令 基因 评估 配置 申请 | ||
【主权项】:
1.一种方法,其包括:至少基于在医疗受试者的组织的提取样品中测量的一种或多种细胞信号传导途径的一个或多个目标基因的一个或多个表达水平(20)来推断所述医疗受试者的组织中的一种或多种细胞信号传导途径的活性,其中所述推断包括:通过评价概率模型(40‑1,...,40‑7)优选Bayesian网络(40‑1,...,40‑7)的至少一部分来推断医疗受试者的组织中一种或多种细胞信号传导途径的活性,其表示对于一组输入的一种或多种细胞信号传导途径,所述一组输入包括至少在医疗受试者的组织的提取样品中测量的一种或多种细胞信号传导途径的一个或多个目标基因的一个或多个表达水平(20);估计医疗受试者的组织中至少一种转录因子(TF)元件(至少一个控制一种或多种细胞信号传导途径的一个或多个目标基因的TF元件)的水平(46),所述估计至少部分基于与至少一个TF元件和在医疗受试者的组织的提取样品中测量的一种或多种细胞信号传导途径的一个或多个目标基因的一个或多个表达水平(20)有关的条件概率;基于组织样品中转录因子的估计水平来推断一种或多种细胞信号传导途径的活性;和基于医疗受试者的组织中的一种或多种细胞信号传导途径的推断活性来确定在医疗受试者的组织中一种或多种细胞信号传导途径是否运行异常;其中通过数字处理设备(12)使用一种或多种细胞信号传导途径的所述概率模型(40‑1,...,40‑7)来进行所述推断。
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