[发明专利]病毒基因组突变检测方法、装置和存储介质在审
申请号: | 201811222711.8 | 申请日: | 2018-10-19 |
公开(公告)号: | CN111073998A | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
发明(设计)人: | 郭小森;宁小莲;李力强;刘韧 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12M1/34;C12M1/00;G16B20/50 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 孙银行;彭家恩 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 一种病毒基因组突变检测方法、装置和存储介质,该方法包括:获取病毒的全基因组文库或目标区域文库的二代测序数据,其包括病毒的全基因组或目标区域的测序读长;将测序读长比对到病毒的参考基因组上获得正确比对上的测序读长;将全部正确比对上的测序读长上的碱基直接翻译成氨基酸残基;统计每条测序读长上每个位点的氨基酸残基,获得每种测序读长上每个位点的各种氨基酸残基的比例;根据比例分析出每个位点的氨基酸突变情况。该方法能够获取全部病毒准种基因组数据,全面、准确反映出宿主体内真实存在的病毒准种,且可检测病毒全部变异位点。 | ||
搜索关键词: | 病毒 基因组 突变 检测 方法 装置 存储 介质 | ||
【主权项】:
暂无信息
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