[发明专利]一种基于DNA片段富集及测序技术的产前无创胎儿染色体检测系统

摘要

本发明公开了一种基于DNA片段特异性富集检测产前胎儿染色体异常的方法，该方法通过获取孕妇外周血并通过DNA富集技术得到游离DNA，富集DNA操作中使用探针杂交捕获的富集方法，该富集方法同时富集母亲和胎儿的特异片段，而无需仅对胎儿DNA进行富集，该检测方法不仅实现了胎儿整条染色体含量的检测，还实现了胎儿局部染色体含量的检测，该方法应用到孕妇血浆游离DNA检测胎儿染色体异常精确度高。

主权项

1.一种基于DNA片段特异性富集及第二代测序技术的产前无创胎儿染色体检测系统，其特征在于：所述系统包括四个模块，所述模块被配置用于实施富集检测产前胎儿染色体异常的方法，该方法包括：（1）获取孕妇外周血样本，分离样本中的血浆游离DNA；（2）使用人类基因组全部外显子的DNA探针对步骤（1）得到的血浆游离DNA进行探针杂交捕获富集，同时富集母亲和胎儿的特异片段，得到DNA片段；（3）对步骤（2）富集到的DNA片段进行测序，平均测序深度大于100X；（4）根据步骤（3）得到的测序结果，识别测序得到的每个DNA序列在人类参考基因组上的位置，对于人类参考基因组上每个目标富集区域，将识别到的该区域的DNA序列计数，对于N个不重叠的目标富集区域，每个目标富集区域的宽度为50‑500碱基，得到N个计数，按照人类参考基因组上的位置将N个数排成一个向量A；（5）将无染色体异常的孕妇的外周血样本，按照与步骤（1）‑（4）相同方法计算每个目标富集区域的所有样本的序列数的均值，得出向量B；（6）使用如下方法得到向量C=(C_i)，其中A_i是向量A的第i个元素，B_i是向量B的第i个元素；C_i是向量C的第i个元素；C_i=A_i/B_i。