[发明专利]基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法及系统有效
申请号: | 201811339248.5 | 申请日: | 2018-11-12 |
公开(公告)号: | CN109727644B | 公开(公告)日: | 2021-09-07 |
发明(设计)人: | 刁玉涛;成丽娟;陈芳;刘红艳;李莲莲;张晓瑜;阴海鹏;张之勇 | 申请(专利权)人: | 山东省医学科学院基础医学研究所 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B45/00;G06F8/34 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 张庆骞 |
地址: | 250062 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本公开提供了一种基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法及系统。其中,一种基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法,包括:聚类微生物基因组二代测序数据,相似性高于预设阈值的微生物基因组序列聚类为一个OTU,每个OTU对应一个微生物品种,生成OTUs表数据;合并OTUs表数据中具有相同来源的标本;将合并后的OTUs表数据导入Excel表中,通过Excel函数生成可被R语言VennDiagram包所识别的向量;通过R语言VennDiagram包绘制Venn图。 | ||
搜索关键词: | 基于 微生物 基因组 二代 序数 venn 制作方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法,其特征在于,包括:聚类微生物基因组二代测序数据,相似性高于预设阈值的微生物基因组序列聚类为一个OTU,每个OTU对应一个微生物品种,生成OTUs表数据;合并OTUs表数据中具有相同来源的标本;将合并后的OTUs表数据导入Excel表中,通过Excel函数生成可被R语言VennDiagram包所识别的向量;通过R语言VennDiagram包绘制Venn图。
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