[发明专利]基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法及系统有效

专利信息
申请号: 201811339248.5 申请日: 2018-11-12
公开(公告)号: CN109727644B 公开(公告)日: 2021-09-07
发明(设计)人: 刁玉涛;成丽娟;陈芳;刘红艳;李莲莲;张晓瑜;阴海鹏;张之勇 申请(专利权)人: 山东省医学科学院基础医学研究所
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B45/00;G06F8/34
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 张庆骞
地址: 250062 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 本公开提供了一种基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法及系统。其中,一种基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法,包括:聚类微生物基因组二代测序数据,相似性高于预设阈值的微生物基因组序列聚类为一个OTU,每个OTU对应一个微生物品种,生成OTUs表数据;合并OTUs表数据中具有相同来源的标本;将合并后的OTUs表数据导入Excel表中,通过Excel函数生成可被R语言VennDiagram包所识别的向量;通过R语言VennDiagram包绘制Venn图。
搜索关键词: 基于 微生物 基因组 二代 序数 venn 制作方法 系统
【主权项】:
1.一种基于微生物基因组二代测序数据的Venn图制作方法,其特征在于,包括:聚类微生物基因组二代测序数据,相似性高于预设阈值的微生物基因组序列聚类为一个OTU,每个OTU对应一个微生物品种,生成OTUs表数据;合并OTUs表数据中具有相同来源的标本;将合并后的OTUs表数据导入Excel表中,通过Excel函数生成可被R语言VennDiagram包所识别的向量;通过R语言VennDiagram包绘制Venn图。
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