[发明专利]微生物二代测序数据的宏基因组分析方法及系统在审

专利信息
申请号: 201811339970.9 申请日: 2018-11-12
公开(公告)号: CN109741790A 公开(公告)日: 2019-05-10
发明(设计)人: 徐强;尚河颖;张晓瑜;李莲莲;阴海鹏;刘红艳;刁玉涛;张之勇;俞勇 申请(专利权)人: 山东省医学科学院基础医学研究所
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B40/00
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 张庆骞
地址: 250062 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 本公开提供了一种微生物二代测序数据的宏基因组分析方法及系统。其中,一种微生物二代测序数据的宏基因组分析方法,包括:聚类微生物基因组二代测序数据,相似性高于预设阈值的微生物基因组序列聚类为一个OTU,每个OTU对应一个微生物品种,生成OTUs表数据;标准化处理OTUs表数据;将标准化处理后的OTUs表数据映射到宏基因组功能;统计分析不同宏基因组功能的基因丰度差异,并输出图形化分析结果。
搜索关键词: 测序数据 宏基因组分析 表数据 微生物 微生物基因组 标准化处理 宏基因组 微生物品种 丰度差异 输出图形 序列聚类 统计分析 映射 聚类 预设 基因
【主权项】:
1.一种微生物二代测序数据的宏基因组分析方法,其特征在于,包括:聚类微生物基因组二代测序数据,相似性高于预设阈值的微生物基因组序列聚类为一个OTU,每个OTU对应一个微生物品种,生成OTUs表数据;标准化处理OTUs表数据;将标准化处理后的OTUs表数据映射到宏基因组功能;统计分析不同宏基因组功能的基因丰度差异,并输出图形化分析结果。
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