[发明专利]一种西北春小麦全基因组关联分析方法

摘要

本发明公开了一种西北春小麦全基因组关联分析方法。包括：选择小麦种子种植；成熟期测株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数；成熟后收获种子，测种子粒宽、粒长、重量，计算千粒重；用CTAB法提取DNA，制备DArT芯片；采用STRUCTURE计算小麦品种群体结构，利用贝叶斯模型划分群体结构，采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析，获得与产量和种子特性相关的DArT分子标记；包括12个株高关联标记；2个穗长相关标记；8个小穗数相关标记；3个穗粒数关标记；4个不实小穗数关联标记；3个粒长关联标记；1个千粒重关联标记；4个粒宽关联标记。本发明的DArT分子标记可应用于农业育种中。

主权项

1.一种西北春小麦全基因组关联分析方法，其特征在于，所述方法包括：选择小麦种子并种植；成熟期，测量株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数；成熟后，收获种子，采用高通量分子仪测定收获种子的粒宽、粒长、重量，计算千粒重；用CTAB法提取DNA，将DNA浓度调至约50‑100ng·μl‑1，制备DArT芯片；采用STRUCTURE计算小麦品种的群体结构，利用贝叶斯模型划分群体结构，采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析，分别获得与产量和种子特性相关的DArT分子标记；所述分子标记包括：与株高相关的DArT分子标记的数量为12个，分别位于2BS、2BL、3AL、3DL、4AL、6BL和7BL染色体上；与穗长相关的DArT分子标记的数量为2个，分别位于1BL和1DS染色体上；与小穗数相关的DArT分子标记的数量为8个，分别位于2BL、4AL、4BS和7AS染色体上；与穗粒数相关的DArT分子标记的数量为3个，分别位于2BS、3B、4AS染色体上；与不实小穗数相关的DArT分子标记的数量为4个，分别位于4AL和2AS染色体上；与粒长相关的DArT分子标记的数量为3个，分别位于3AL、3DL和6BL染色体上；与千粒重相关的DArT分子标记的数量为1个，分别位于4BS染色体上；与粒宽相关的DArT分子标记的数量为4个，分别位于1BL、4BS和6BS染色体上。