[发明专利]癌症特异的共调网络建立方法及装置有效
| 申请号： | 201811492500.6 | 申请日： | 2018-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN109616152B | 公开（公告）日： | 2020-01-03 |
| 发明（设计）人： | 李睿江;陈河兵;卢一鸣;李昊;江帅;洪浩;李宛莹;黄昕;赵诚辉;张卓;伯晓晨 | 申请（专利权）人： | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
| 主分类号： | G16B5/00 | 分类号： | G16B5/00;G16B25/10 |
| 代理公司： | 11371 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人： | 王文红 |
| 地址： | 100000 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种癌症特异的共调网络建立方法及装置，属于癌症调控网络建立技术领域。所述方法包括：根据公开数据库获得TF和miRNA对靶基因的TF调控信息和miRNA调控信息；根据TF调控信息和miRNA调控信息建立三元调控网络；识别所述三元调控网络中的FFLs，获得FFLs识别结果；根据FFLs识别结果和癌症基因组表达量信息，筛选得到癌症特异的miRNA‑TF共调网络。本发明建立了TF，miRNA和靶基因的三元调控网络，并结合基因表达信息，获得miRNA‑TF共调网络，提高了miRNA‑TF共调控关系的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 调控信息 癌症 网络建立 调控 网络 基因组表达 表达信息 调控关系 结合基因 靶基因 量信息 对靶 数据库 筛选 基因 | ||
【主权项】：
1.一种癌症特异的共调网络建立方法，其特征在于，包括：/n根据公开数据库获得TF和miRNA对靶基因的TF调控信息和miRNA调控信息；/n根据TF调控信息和miRNA调控信息建立三元调控网络；/n识别所述三元调控网络中的FFLs，获得FFLs识别结果；/n根据FFLs识别结果和癌症基因组表达量信息，筛选得到癌症特异的miRNA-TF共调网络；/n所述FFLs是miRNA和TF共同调控靶基因的形式，包括TF-FFLs、miRNA-FFLs和复合FFLs三种类型；/n所述TF-FFLs中，TF是主要调控者；/n所述miRNA-FFLs中，miRNA是主要调控者；/n所述复合FFLs中，miRNA和TF相互调节，所述复合FFLs由所述TF-FFLs和miRNA-FFLs结合形成；/n所述识别所述三元调控网络中的FFLs，获得FFLs识别结果，具体包括：/n根据网络模体挖掘算法在所述三元调控网络中识别FFLs，获得FFLs识别结果；/n所述根据FFLs识别结果和癌症基因组表达量信息，筛选得到癌症特异的miRNA-TF共调网络，具体包括：/n根据FFLs识别结果和癌症基因组表达量信息，利用统计检验、网络推理算法或基因富集分析得到miRNA和TF对癌症基因组靶基因的共调关系，并根据所述共调关系建立癌症特异的miRNA-TF共调网络。/n
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