[发明专利]一种基于R软件的微生物组差异显著性分析及作图方法在审
| 申请号： | 201811520239.6 | 申请日： | 2018-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN109994157A | 公开（公告）日： | 2019-07-09 |
| 发明（设计）人： | 寇文伯;薛正晟;孙子奎 | 申请（专利权）人： | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B45/00 | 分类号： | G16B45/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人： | 吕伴 |
| 地址： | 200030 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于R软件的微生物组差异显著性分析及作图方法，包括如下步骤：数据输入步骤：接收用户输入的测试数据；测试步骤：根据需要，选择测试方法；不同的检验采用不同的函数执行；绘图步骤：输出文本测试结果，根据测试数据输出图片；添加注释步骤：对测试结果中不符合假设(平均值不同)的变量进行标注。本发明的有益效果在于：结果更加全面易懂，测试方法更全面，分析更加准确。 | ||
| 搜索关键词： | 差异显著性分析 测试数据 微生物组 数据输入步骤 测试步骤 函数执行 绘图步骤 接收用户 输出图片 输出文本 选择测试 注释步骤 标注 测试 检验 分析 | ||
【主权项】：
1.一种基于R软件的微生物组差异显著性分析及作图方法，其特征在于，包括如下步骤：数据输入步骤：接收用户输入的测试数据；测试步骤：根据需要，选择测试方法，所述的测试方法包括方差分析(ANOVA)、t检验、Kruskal‑Wallis检验、Wilcoxon检验(非参数方法)；其中，所述的方差分析(ANOVA)、t检验是针对正态假设的稳健检验；所述的Kruskal‑Wallis检验、Wilcoxon检验(非参数方法)是当违反方差同质性假设时使用；所述的t检验、Wilcoxon检验用于比较两个群体的平均值；所述的方差分析、Kruskal‑Wallis检验用于比较两个以上群体间的平均值；其中，方差检验通过stats包的aov函数执行，随后通过stats包的TukeyHSD函数执行两两比较；T检验通过stats包的t.test函数执行；Kruskal‑Wallis检验通过stats包kruskal.test函数执行，随后通过PMCMR包posthoc.kruskal.conover.test函数执行两两比较；Wilcoxon检验通过stats包wilcox.test函数执行；绘图步骤：输出文本测试结果，根据测试数据输出图片；添加注释步骤：对测试结果结果中不符合假设的变量进行标注。
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