[发明专利]一种基于逻辑判断的原子尺度DNA测序方法有效
申请号: | 201811559707.0 | 申请日: | 2018-12-20 |
公开(公告)号: | CN109652519B | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 贾瑜;王红艳;牛春要;赵玉;关绍康 | 申请(专利权)人: | 郑州大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 成都其高专利代理事务所(特殊普通合伙) 51244 | 代理人: | 廖曾 |
地址: | 450001 河南省郑*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | 本发明提供了一种DNA测序方法,该方法采用单壁碳纳米管作为测序通道,且该通道的长度每次仅能容纳两个碱基对,测序通道内的碱基对只能有4种组合,分别为(CG,CG)、(CG,AT)、(AT,CG)、和(AT,AT),相应地,测序通道内碱基对间的氢键个数分别为6、5、5、4,不同数量的氢键使碱基对碳纳米管的作用力不同,进而影响碳纳米管的声子谱。对于具有5个氢键的组合,需对其相邻碱基进行逻辑判断,实现对DNA的单个碱基对的测序。目前常规固态纳米孔由于通道太长无法实现对单个碱基分辨,而采用二维纳米孔虽能对单个碱基或碱基对进行检测,但检测信号分辨率过低。该测序方法有效解决了常规固体纳米孔存在的不足,提高了单对碱基的分辨率。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 逻辑 判断 原子 尺度 dna 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于逻辑判断的DNA原子尺度的测序方法,其特征在于,设计出纳米尺度的DNA测序通道,测序通道的长度每次仅能容纳两个碱基对,当双链DNA通过该通道时,通过拉曼光谱检测碳纳米管的声子振动图谱并与计算给出标准振动图谱进行比较,能够实现对碱基对组合(CG,CG)和(AT,AT)的分辨;通过对相邻碱基对的逻辑推断,可以区分碱基对组合(CG,AT)和(AT,CG),进而实现对DNA的单个碱基对的测序功能。
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