[发明专利]一种基于简化基因组测序的测序样品的处理方法在审
申请号: | 201811594696.X | 申请日: | 2018-12-25 |
公开(公告)号: | CN109680041A | 公开(公告)日: | 2019-04-26 |
发明(设计)人: | 施冬青;黄小毛;朱月艳;孙子奎 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人: | 吕伴 |
地址: | 200030 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于简化基因组测序的测序样品的处理方法,包括如下步骤:步骤一:提取目标基因组DNA;步骤二:将步骤(1)所得基因组DNA进行定量;步骤三:根据步骤(2)DNA浓度测定结果,选取500ng DNA作为酶切起始量,使用EcoR1和Mse1进行组合酶切,酶切时间至少3个小时;步骤四:以步骤(3)所得DNA酶切产物进行后续建库,并上机测序。本发明的有益效果在于:本发明通过优化测序当中的测序起始量、酶切时间,接头的碱基平衡,就能够有效的增加文库的有效数据比例和高质量的数据的产出。 | ||
搜索关键词: | 测序 酶切 基因组测序 测序样品 起始量 目标基因组 基因组DNA 有效数据 组合酶 碱基 上机 文库 平衡 优化 | ||
【主权项】:
1.一种基于简化基因组测序的测序样品的处理方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一:提取目标基因组DNA;步骤二:将步骤(1)所得基因组DNA进行定量;步骤三:根据步骤(2)DNA浓度测定结果,选取500ng DNA作为酶切起始量,使用EcoR1和Mse1进行组合酶切,酶切时间至少3个小时;步骤四:以步骤(3)所得DNA酶切产物进行后续建库,并上机测序。
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