[发明专利]一种单细胞基因组目标区域捕获的方法有效
申请号: | 201811596459.7 | 申请日: | 2018-12-26 |
公开(公告)号: | CN109957615B | 公开(公告)日: | 2023-07-21 |
发明(设计)人: | 洪燕;惠峰;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 | 申请(专利权)人: | 北京安诺优达医学检验实验室有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
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地址: | 100176 北京市大兴区经济技术开*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种单细胞基因组目标区域捕获的方法。具体的通过对单细胞基因组进行全基因组扩增,对扩增后的基因组进行打断、末端修复、3'端加A、加接头、PCR扩增、目标区域捕获、对目标区域捕获的DNA片段进行PCR扩增及测序。通过本发明提供的方法可以提高捕获测序结果的覆盖度,提高捕获结果的特异性。 | ||
搜索关键词: | 一种 单细胞 基因组 目标 区域 捕获 方法 | ||
【主权项】:
1.一种单细胞基因组目标区域捕获的方法,包括:步骤A:采用多重置换扩增方法对单细胞基因组进行等温扩增,获得扩增后的基因组;步骤B:取3μg扩增后的基因组进行打断,获得片段化的DNA片段;步骤C:将片段化的DNA片段进行末端修复,获得平末端DNA片段;步骤D:将平末端DNA片段进行3'端加A,获得3'端加A的DNA片段;步骤E:将3'端加A的DNA片段进行加接头,获得加接头的DNA片段;步骤F:将加接头的DNA片段进行PCR扩增,获得扩增的DNA片段;步骤G:将扩增的DNA片段进行目标区域捕获,获得捕获的DNA片段;步骤H:将捕获的DNA片段进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;步骤I:将PCR扩增产物进行测序;其中,所述步骤A中等温扩增的条件为30℃反应2小时;所述步骤F中PCR扩增的循环数为4~6个循环;所述步骤G中目标区域捕获的条件为65℃反应16~24小时。
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