[发明专利]一种基于基因组测序的微卫星不稳定性检测系统及方法有效

专利信息
申请号: 201811641480.4 申请日: 2018-12-29
公开(公告)号: CN109637590B 公开(公告)日: 2020-06-19
发明(设计)人: 叶凯;贾鹏;杨晓飞;刘博文;康永永;梁皓 申请(专利权)人: 西安交通大学
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 安彦彦
地址: 710049 陕*** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 一种基于基因组测序的微卫星不稳定性检测系统及方法,微卫星检测位点选择:根据对某种肿瘤样本的测序数据,选择有效检测位点,计算有效检测位点对应的单个微卫星位点不稳定性的阈值以及某种肿瘤样本微卫星不稳定性的评价标准;根据有效检测位点对应的单个微卫星位点不稳定性的阈值以及某种肿瘤样本微卫星不稳定性的评价标准,对检测样本进行微卫星不稳定性检测。本发明不依赖对照样本,可以减少取样是给被检测者带来的痛苦;对照样本中含有被测试者的全部的遗传信息,本发明不使用对照样本可以减少对被测试者隐私泄露的可能性;不检测对照样本可以减少检测的成本。本发明操作方便,成本低,可信度高。
搜索关键词: 一种 基于 基因组 卫星 不稳定性 检测 系统 方法
【主权项】:
1.一种基于基因组测序的微卫星不稳定性检测系统,其特征在于,包括微卫星检测位点选择模块和微卫星不稳定性检测模块;其中,所述微卫星检测位点选择模块用于根据对某种肿瘤样本的测序数据,选择有效检测位点,计算有效检测位点对应的单个微卫星位点不稳定性的阈值以及某种肿瘤样本微卫星不稳定性的评价标准;微卫星不稳定性检测模块用于根据微卫星检测位点选择模块得到的有效检测位点对应的单个微卫星位点不稳定性的阈值以及某种肿瘤样本微卫星不稳定性的评价标准,对检测样本进行微卫星不稳定性检测。
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