[发明专利]移相校正

摘要

存储器高效性方法从在碱基识别循环期间由核酸测序仪采集的图像数据确定校正的颜色值。这种方法可以：(a)获得包括多个读取核酸碱基的位点的基板(例如，流动池的一部分)的图像；(b)从基板的图像测量多个位点的颜色值；(c)将所述颜色值存储在所述测序仪的一个或多个处理器的处理器缓冲区中；(d)检索所述多个位点的部分相位校正的颜色值，其中所述部分相位校正的颜色值在紧邻的前一碱基识别循环期间存储在所述测序仪的存储器中；(e)确定预移相校正；(f)确定校正的颜色值。在各种实现方案中，这些操作都在单个碱基识别循环期间执行。在某些实施方式中，该方法还包括使用校正的颜色值来对多个位点进行碱基识别。可以设计或配置测序仪以实施这样的方法。

主权项

1.一种通过核酸测序仪在碱基识别循环期间从所采集的图像数据确定校正颜色值的方法，所述核酸测序仪包括图像采集系统、一个或多个处理器、和存储器，所述方法包括：(a)获得包含多个读取核酸碱基的位点的基板的图像，其中所述位点显示代表核酸碱基类型的颜色；(b)从所述基板的图像测量多个位点的颜色值；(c)将所述颜色值存储在所述测序仪的一个或多个处理器的处理器缓冲区中；(d)检索所述多个位点的经部分相位校正的颜色值，其中所述经部分相位校正的颜色值在紧邻的前一个碱基识别循环期间存储在所述测序仪的存储器中；(e)根据以下确定预移相校正：在紧邻的前一个碱基识别循环期间存储的所述经部分相位校正的颜色值，和存储在所述处理器缓冲区中的颜色值；和(f)根据以下确定校正的颜色值：所述处理器缓冲区中的颜色值，在紧邻的前一个循环期间存储的部分相位校正值，和所述预移相校正。